Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Strbp-201ENSMUST00000028279 16348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Skint3-201ENSMUST00000038455 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Olfr1028-201ENSMUST00000080698 3474 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Abca16-201ENSMUST00000056042 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Cfh-206ENSMUST00000192880 3746 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Zfp980-201ENSMUST00000105738 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm22939-201ENSMUST00000103958 131 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Mir6398-201ENSMUST00000184541 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Mir6715-201ENSMUST00000184990 57 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm29259-201ENSMUST00000186396 694 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm28069-201ENSMUST00000189926 214 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 4930555G07Rik-202ENSMUST00000219879 750 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Olfr924-201ENSMUST00000072977 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Pak3-204ENSMUST00000112865 8484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 AC153522.2-201ENSMUST00000218389 3853 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Zfp595-203ENSMUST00000168892 4040 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Olfr1263-202ENSMUST00000214382 4400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Cr2-212ENSMUST00000210219 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 4933436I01Rik-201ENSMUST00000026325 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm8475-201ENSMUST00000118211 526 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm37279-201ENSMUST00000194630 338 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Igkv9-128-201ENSMUST00000196602 353 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 AC123618.1-201ENSMUST00000220174 360 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 4930455B14Rik-204ENSMUST00000224776 848 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Fam111a-204ENSMUST00000151307 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 AC132336.1-201ENSMUST00000222844 1740 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Pik3c2a-201ENSMUST00000170430 8044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 9330159F19Rik-201ENSMUST00000092627 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Olfr393-202ENSMUST00000213365 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Macc1-205ENSMUST00000222784 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 AC135119.1-201ENSMUST00000227935 3717 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm13761-201ENSMUST00000117238 807 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm14649-201ENSMUST00000121814 324 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm11640-201ENSMUST00000155987 272 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 AC123064.2-201ENSMUST00000217758 193 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Olfr469-202ENSMUST00000213252 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Olfr1408-202ENSMUST00000200689 3453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm10287-202ENSMUST00000180599 4059 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm24119-201ENSMUST00000103979 246 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm5943-201ENSMUST00000119458 459 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm29105-201ENSMUST00000187256 450 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm29218-205ENSMUST00000190846 615 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm42990-201ENSMUST00000199231 312 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 AC139294.1-201ENSMUST00000226708 571 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Olfr969-201ENSMUST00000074566 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Olfr1290-201ENSMUST00000099616 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Olfr273-202ENSMUST00000107670 4796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Abca5-201ENSMUST00000043961 8231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm44164-201ENSMUST00000203605 2561 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm14387-201ENSMUST00000121827 2055 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm36298-201ENSMUST00000223394 1732 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm18189-201ENSMUST00000218153 1951 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm11923-201ENSMUST00000118135 508 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm11830-201ENSMUST00000120175 561 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm26027-201ENSMUST00000122725 268 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm16101-201ENSMUST00000160695 430 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Snord92-201ENSMUST00000175548 85 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm18867-201ENSMUST00000198022 1179 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
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