Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 4930505K14Rik-201ENSMUST00000155504 515 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm25713-201ENSMUST00000158625 109 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm2862-201ENSMUST00000161524 328 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Ighv1-77-201ENSMUST00000170551 294 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm29193-201ENSMUST00000187129 830 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm28786-201ENSMUST00000187228 172 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm28685-201ENSMUST00000187545 1101 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm8242-202ENSMUST00000193056 475 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm18984-201ENSMUST00000193998 1124 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm4052-201ENSMUST00000220890 451 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 AC134596.2-201ENSMUST00000222158 171 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Olfr844-201ENSMUST00000054106 930 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Olfr209-201ENSMUST00000055868 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Olfr744-201ENSMUST00000066457 1105 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Olfr883-201ENSMUST00000072974 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Mir30e-201ENSMUST00000083475 92 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Olfr154-201ENSMUST00000099918 1079 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm42448-201ENSMUST00000197122 2644 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 AC153948.1-201ENSMUST00000219080 3838 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1404-203ENSMUST00000217374 3686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Olfr818-203ENSMUST00000215527 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Olfr142-202ENSMUST00000213968 3630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Svs2-201ENSMUST00000044953 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Mcmdc2-203ENSMUST00000125294 2003 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm23178-201ENSMUST00000116782 95 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm11923-201ENSMUST00000118135 508 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm24014-201ENSMUST00000157728 157 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Obox4-ps26-201ENSMUST00000176368 724 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm27477-201ENSMUST00000184649 143 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm37828-201ENSMUST00000192496 432 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 1700027F06Rik-201ENSMUST00000203901 243 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm43971-201ENSMUST00000205010 743 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm18252-201ENSMUST00000214814 527 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm17829-201ENSMUST00000219782 344 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 AC166056.1-201ENSMUST00000223139 441 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm23518-201ENSMUST00000082835 153 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm25200-201ENSMUST00000083094 130 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm38073-201ENSMUST00000195141 3665 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm38207-201ENSMUST00000193009 3505 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Olfr263-202ENSMUST00000215804 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 CT025577.1-201ENSMUST00000220862 2846 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm26733-201ENSMUST00000180846 2046 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps36-201ENSMUST00000172589 2562 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Olfr836-202ENSMUST00000212730 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Pramel6-202ENSMUST00000111572 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Macf1-203ENSMUST00000097897 23495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 6720427I07Rik-201ENSMUST00000181490 2300 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Olfr483-202ENSMUST00000215159 2691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Olfr988-203ENSMUST00000215511 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm20619-201ENSMUST00000175814 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm24469-201ENSMUST00000104487 131 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 2210407C18Rik-202ENSMUST00000108821 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Klrc2-203ENSMUST00000118401 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps2-201ENSMUST00000121053 765 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm11645-201ENSMUST00000121589 649 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 9130015L21Rik-201ENSMUST00000140319 606 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm25913-201ENSMUST00000157617 135 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm1992-201ENSMUST00000161581 250 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Sult3a2-201ENSMUST00000165904 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r126-201ENSMUST00000168398 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm38061-201ENSMUST00000192490 365 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 4930503O07Rik-201ENSMUST00000193395 578 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 9530022L04Rik-201ENSMUST00000194340 310 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm33973-201ENSMUST00000195148 534 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm43853-201ENSMUST00000197162 301 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1093-203ENSMUST00000219561 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm20474-202ENSMUST00000220772 462 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 AC239878.1-201ENSMUST00000224212 506 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 AL645546.1-201ENSMUST00000225001 189 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm23443-201ENSMUST00000082916 128 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Snord22-201ENSMUST00000083153 126 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm10665-201ENSMUST00000098720 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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