Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Rnf40Q3U319 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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Rnf40Q3U319 Gm38069-201ENSMUST00000195360 2144 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnf40Q3U319 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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Rnf40Q3U319 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnf40Q3U319 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnf40Q3U319 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnf40Q3U319 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Rnf40Q3U319 AC154576.1-201ENSMUST00000225864 563 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnf40Q3U319 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnf40Q3U319 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Rnf40Q3U319 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnf40Q3U319 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Rnf40Q3U319 Nxt2-202ENSMUST00000112913 2538 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnf40Q3U319 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Rnf40Q3U319 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Rnf40Q3U319 Dnase2b-201ENSMUST00000029836 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Rnf40Q3U319 Gm25150-201ENSMUST00000157121 60 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf40Q3U319 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf40Q3U319 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf40Q3U319 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf40Q3U319 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf40Q3U319 Gm38045-201ENSMUST00000193536 199 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf40Q3U319 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf40Q3U319 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf40Q3U319 Gm43214-201ENSMUST00000199242 352 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf40Q3U319 Gm45380-201ENSMUST00000210465 315 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf40Q3U319 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf40Q3U319 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf40Q3U319 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf40Q3U319 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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