Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Ccndbp1Q3TVC7 Ogt-201ENSMUST00000044475 5384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37764-201ENSMUST00000194664 2150 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Ccndbp1Q3TVC7 Ank2-208ENSMUST00000182078 14305 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43665-201ENSMUST00000198672 1659 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Igkv4-70-201ENSMUST00000103348 379 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23594-201ENSMUST00000104307 134 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11146-201ENSMUST00000114231 96 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13087-201ENSMUST00000118298 256 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15916-201ENSMUST00000118355 736 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11869-201ENSMUST00000118701 329 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14500-201ENSMUST00000121647 113 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Defa-ps12-201ENSMUST00000122353 193 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Magea9-ps-201ENSMUST00000140655 732 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26373-201ENSMUST00000157833 103 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23032-201ENSMUST00000157995 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16318-201ENSMUST00000162402 601 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Magea9-ps-202ENSMUST00000167328 899 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Nutf2-ps2-201ENSMUST00000179225 384 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26983-201ENSMUST00000182051 388 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Mir7056-201ENSMUST00000183776 59 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44254-201ENSMUST00000204184 322 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2516-201ENSMUST00000210011 954 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr613-202ENSMUST00000214173 3840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10037-202ENSMUST00000221266 549 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Klra6-201ENSMUST00000074056 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Igsf10-202ENSMUST00000193455 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn2r-ps43-201ENSMUST00000173798 2473 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3665-201ENSMUST00000177214 2461 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn2r-ps51-201ENSMUST00000177271 2461 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38407-202ENSMUST00000219221 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15304-201ENSMUST00000122150 2640 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43092-201ENSMUST00000202986 1854 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Cmah-206ENSMUST00000167746 9727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 A530099J19Rik-201ENSMUST00000151029 2764 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl15-204ENSMUST00000113915 6241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Mga-203ENSMUST00000110773 13577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38152-201ENSMUST00000195389 3566 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn2r26-201ENSMUST00000032238 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Nexn-212ENSMUST00000199470 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26384-201ENSMUST00000102183 110 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22498-201ENSMUST00000104497 86 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7834-201ENSMUST00000117560 437 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12571-201ENSMUST00000118132 243 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14322-202ENSMUST00000119838 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14162-201ENSMUST00000121985 601 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14418-202ENSMUST00000128657 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11579-201ENSMUST00000145502 845 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11917-201ENSMUST00000154813 373 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24251-201ENSMUST00000157324 114 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24507-201ENSMUST00000157683 134 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r103-201ENSMUST00000163461 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r151-201ENSMUST00000166079 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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