Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Cpne9Q1RLL3 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Cpne9Q1RLL3 Gm44403-201ENSMUST00000198554 129 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Cpne9Q1RLL3 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Cpne9Q1RLL3 Gm8785-201ENSMUST00000220259 487 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Cpne9Q1RLL3 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Cpne9Q1RLL3 AC117797.2-201ENSMUST00000224419 531 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Cpne9Q1RLL3 AC187103.4-202ENSMUST00000225091 230 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Cpne9Q1RLL3 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Cpne9Q1RLL3 AC154419.1-201ENSMUST00000227627 272 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Cpne9Q1RLL3 Mcmdc2-204ENSMUST00000140948 3249 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Cpne9Q1RLL3 Gm29674-202ENSMUST00000219664 4083 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Cpne9Q1RLL3 Gulp1-206ENSMUST00000162600 2798 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Cpne9Q1RLL3 Gm5724-201ENSMUST00000148411 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Cpne9Q1RLL3 Olfr1369-ps1-204ENSMUST00000215207 3794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Cpne9Q1RLL3 Gm9078-201ENSMUST00000119126 617 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Crem-222ENSMUST00000144496 978 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm11337-201ENSMUST00000144770 335 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Rgs2-204ENSMUST00000153527 588 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm23592-201ENSMUST00000157859 117 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm23773-201ENSMUST00000158985 296 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm23775-201ENSMUST00000158991 249 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm26733-201ENSMUST00000180846 2046 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm29638-201ENSMUST00000186106 371 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm4859-201ENSMUST00000199625 787 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm44059-201ENSMUST00000204048 351 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm34779-201ENSMUST00000210036 263 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Olfr1370-203ENSMUST00000215357 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 4930555G07Rik-202ENSMUST00000219879 750 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm18388-201ENSMUST00000222339 557 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 AC167013.2-202ENSMUST00000227035 333 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 AC115291.2-201ENSMUST00000228335 437 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Ly6a-201ENSMUST00000023248 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Olfr1136-201ENSMUST00000077471 1067 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Prl2b1-201ENSMUST00000091678 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Zfp273-203ENSMUST00000181391 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm34549-201ENSMUST00000207057 1611 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Fbxw14-201ENSMUST00000112041 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm5653-201ENSMUST00000223393 1337 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r89-202ENSMUST00000226717 4120 ntAPPRIS P2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm37970-201ENSMUST00000193865 1732 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm3956-201ENSMUST00000164882 2560 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r36-201ENSMUST00000170402 2561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Olfr1477-201ENSMUST00000214274 3913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 A230004M16Rik-202ENSMUST00000139508 4468 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm38286-201ENSMUST00000195128 3105 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm8011-201ENSMUST00000172163 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Igkv7-33-201ENSMUST00000103376 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm14541-201ENSMUST00000118985 157 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm12691-201ENSMUST00000120186 456 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm15038-201ENSMUST00000122144 296 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm24961-201ENSMUST00000157918 184 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm25860-201ENSMUST00000158252 126 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm23152-201ENSMUST00000175322 116 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Mir5710-201ENSMUST00000176884 69 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm15143-201ENSMUST00000178180 714 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm19243-201ENSMUST00000198592 269 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Olfr490-202ENSMUST00000211345 1275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 AC160124.1-201ENSMUST00000215539 519 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 4930540M03Rik-201ENSMUST00000216952 437 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 AC154742.1-201ENSMUST00000223477 573 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 AC165366.1-201ENSMUST00000225905 505 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Acrv1-201ENSMUST00000034620 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Olfr167-201ENSMUST00000054606 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Olfr918-201ENSMUST00000055099 978 ntAPPRIS P2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Olfr661-201ENSMUST00000098168 964 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm45352-201ENSMUST00000210140 1452 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Olfr186-202ENSMUST00000206463 2208 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 AC124562.2-201ENSMUST00000223888 2313 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Slco1a4-203ENSMUST00000165990 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 AC158921.1-201ENSMUST00000227861 3468 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 D930036K23Rik-201ENSMUST00000191894 3964 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm25833-201ENSMUST00000104137 133 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm23532-201ENSMUST00000104569 112 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Cav1-203ENSMUST00000115454 613 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm14811-201ENSMUST00000117070 117 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm13692-201ENSMUST00000120774 371 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Rps15a-ps3-201ENSMUST00000121072 395 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm12858-201ENSMUST00000121913 208 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm23540-201ENSMUST00000157543 164 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Cpne9Q1RLL3 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms