Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm6988-201ENSMUST00000222676 375 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 CT025689.2-201ENSMUST00000224979 429 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 AC121114.1-201ENSMUST00000228522 570 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Vmn1r26-201ENSMUST00000049694 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Olfr1489-201ENSMUST00000053113 1111 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm23460-201ENSMUST00000083258 109 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Mir465-201ENSMUST00000093563 74 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Dach2-202ENSMUST00000113378 2089 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm44525-201ENSMUST00000183129 2634 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Olfr577-203ENSMUST00000215237 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Elavl2-208ENSMUST00000107120 4191 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Vmn1r82-201ENSMUST00000072801 4784 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Agtr2-201ENSMUST00000089188 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Olfr1178-202ENSMUST00000214040 6480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Olfr944-203ENSMUST00000215306 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 AC142245.1-201ENSMUST00000226611 1505 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Pde1a-206ENSMUST00000102655 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gmnc-201ENSMUST00000089832 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Defa-ps15-201ENSMUST00000118178 477 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm13194-201ENSMUST00000142299 311 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm24898-201ENSMUST00000158133 106 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps32-201ENSMUST00000174389 956 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm20773-201ENSMUST00000178940 681 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm27254-201ENSMUST00000183926 517 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm27564-201ENSMUST00000185196 96 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm29318-201ENSMUST00000185308 975 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Scgb2b29-ps-201ENSMUST00000187539 331 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm29522-201ENSMUST00000191530 621 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm38281-201ENSMUST00000192301 315 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm19908-201ENSMUST00000204684 391 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm8274-201ENSMUST00000219820 463 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 AC159231.1-201ENSMUST00000225365 226 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 n-R5s220-201ENSMUST00000082926 120 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm26176-201ENSMUST00000083795 105 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm22868-201ENSMUST00000083955 164 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Olfr713-201ENSMUST00000098139 975 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm10704-201ENSMUST00000098952 730 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Olfr1257-202ENSMUST00000111519 2756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm13762-201ENSMUST00000144908 2612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm37045-201ENSMUST00000192016 2463 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 AC153964.1-201ENSMUST00000219677 3142 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm7452-202ENSMUST00000202891 3039 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 AC155805.1-201ENSMUST00000222419 3808 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm11823-201ENSMUST00000130582 2278 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 4930522H14Rik-202ENSMUST00000102725 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Acbd7-201ENSMUST00000115089 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm15752-201ENSMUST00000117427 394 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm15180-201ENSMUST00000117745 492 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm15120-201ENSMUST00000120602 301 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm13932-201ENSMUST00000120873 610 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm13865-201ENSMUST00000120957 865 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm23496-201ENSMUST00000157741 248 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Magea9-ps-202ENSMUST00000167328 899 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps75-201ENSMUST00000173251 213 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 A630095N17Rik-202ENSMUST00000180101 571 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm27535-201ENSMUST00000183814 157 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm28574-201ENSMUST00000185757 699 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm28781-201ENSMUST00000185760 696 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm28339-201ENSMUST00000185845 696 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm29062-201ENSMUST00000186032 694 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm29574-201ENSMUST00000186226 696 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm28828-201ENSMUST00000186601 696 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm28057-201ENSMUST00000186603 615 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm28255-201ENSMUST00000187101 694 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm29307-201ENSMUST00000187367 696 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm28397-201ENSMUST00000187970 699 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm29634-201ENSMUST00000188467 696 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm28896-201ENSMUST00000188609 696 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm29545-201ENSMUST00000188878 694 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm28699-201ENSMUST00000189193 696 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm29196-201ENSMUST00000189239 618 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm29339-201ENSMUST00000189613 696 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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