Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Olfr1031-202ENSMUST00000216807 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Gm11781-201ENSMUST00000118328 472 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Gm13239-201ENSMUST00000119920 637 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Gm15338-201ENSMUST00000151884 552 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Gm25666-201ENSMUST00000157702 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Slco6d1-202ENSMUST00000160796 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Olfr812-203ENSMUST00000205013 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Mir466h-201ENSMUST00000104748 81 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Olfr359-ps1-201ENSMUST00000115977 926 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Gm12691-201ENSMUST00000120186 456 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Gm13677-201ENSMUST00000120739 595 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Gm11677-201ENSMUST00000121349 977 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 4930522O17Rik-201ENSMUST00000155178 447 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Gm29522-201ENSMUST00000191530 621 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Gm45200-201ENSMUST00000207434 919 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd8P23463 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms