Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm37433-201ENSMUST00000192695 678 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm31260-201ENSMUST00000193478 696 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Trbv8-201ENSMUST00000194020 285 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm37441-201ENSMUST00000194430 678 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 A330074H02Rik-201ENSMUST00000194667 1039 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm38107-201ENSMUST00000194873 696 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Csn1s2a-209ENSMUST00000200322 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm26691-203ENSMUST00000200444 479 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm44294-201ENSMUST00000205090 728 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm45523-201ENSMUST00000210712 799 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 AC153852.1-201ENSMUST00000217881 567 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 AC139638.1-201ENSMUST00000218027 364 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm8785-201ENSMUST00000220259 487 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 AC099612.2-201ENSMUST00000226824 721 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Olfr211-201ENSMUST00000065786 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm26176-201ENSMUST00000083795 105 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Olfr1116-201ENSMUST00000090717 924 ntAPPRIS P2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Olfr1105-201ENSMUST00000099868 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Npy6r-201ENSMUST00000042747 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm26853-201ENSMUST00000180757 4010 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm15127-203ENSMUST00000112753 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Vmn1r206-202ENSMUST00000227244 3970 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Cd46-203ENSMUST00000162650 6288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm13219-202ENSMUST00000152599 685 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm27189-201ENSMUST00000184119 190 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 A830019L24Rik-201ENSMUST00000197226 1652 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm43825-201ENSMUST00000199650 734 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 Lrrd1-201ENSMUST00000044039 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 5430402E10Rik-201ENSMUST00000063127 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 Gm45540-201ENSMUST00000209271 3606 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm45389-201ENSMUST00000211163 3399 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Nlrp9a-202ENSMUST00000108387 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Spc25-201ENSMUST00000005365 1352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm43967-201ENSMUST00000203787 301 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm44852-201ENSMUST00000207950 369 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm45367-201ENSMUST00000210171 347 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm45327-201ENSMUST00000211612 565 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Olfr892-ps1-201ENSMUST00000211998 932 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 AC159472.1-201ENSMUST00000218178 463 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm35405-201ENSMUST00000218754 400 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Olfr1291-ps1-202ENSMUST00000219064 897 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm30034-201ENSMUST00000219589 248 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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