Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp35M0QWN7 Vmn1r34-205ENSMUST00000227332 3075 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp35M0QWN7 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp35M0QWN7 Eya4-208ENSMUST00000220299 3615 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp35M0QWN7 Adam24-201ENSMUST00000051614 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp35M0QWN7 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp35M0QWN7 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp35M0QWN7 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp35M0QWN7 Zfp131-201ENSMUST00000177916 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Usp35M0QWN7 Gnrhr-203ENSMUST00000113372 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp35M0QWN7 Igkv1-131-201ENSMUST00000103306 362 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp35M0QWN7 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp35M0QWN7 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Usp35M0QWN7 Gm12564-201ENSMUST00000119860 321 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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Usp35M0QWN7 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Usp35M0QWN7 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Usp35M0QWN7 Mir6960-201ENSMUST00000183449 61 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp35M0QWN7 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp35M0QWN7 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Usp35M0QWN7 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Usp35M0QWN7 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp35M0QWN7 Olfr112-204ENSMUST00000208832 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp35M0QWN7 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp35M0QWN7 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Usp35M0QWN7 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Usp35M0QWN7 Olfr1324-203ENSMUST00000219631 1152 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp35M0QWN7 Olfr1324-201ENSMUST00000050044 1152 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Usp35M0QWN7 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp35M0QWN7 Ak6-202ENSMUST00000084721 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp35M0QWN7 Olfr593-201ENSMUST00000098206 984 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp35M0QWN7 Btbd35f7-201ENSMUST00000105007 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp35M0QWN7 Btbd35f13-201ENSMUST00000177912 1701 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp35M0QWN7 Dmd-201ENSMUST00000113991 4438 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp35M0QWN7 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp35M0QWN7 Gm36969-201ENSMUST00000194551 2809 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp35M0QWN7 Has2-201ENSMUST00000050544 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp35M0QWN7 Gm13912-201ENSMUST00000156541 1860 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp35M0QWN7 Igsf10-201ENSMUST00000039419 10084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp35M0QWN7 Ddx60-202ENSMUST00000093485 5989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp35M0QWN7 Gm42910-201ENSMUST00000198917 2921 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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