Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Zfp989-202ENSMUST00000146688 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Cd59b-204ENSMUST00000111132 436 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Acbd7-201ENSMUST00000115089 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm12125-201ENSMUST00000117261 736 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Rps15a-ps4-201ENSMUST00000119415 392 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm12515-201ENSMUST00000120116 361 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm25177-201ENSMUST00000122634 117 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm17571-201ENSMUST00000167906 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm2004-203ENSMUST00000179349 195 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm26824-201ENSMUST00000180506 1164 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm29633-204ENSMUST00000187737 675 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm29443-202ENSMUST00000190297 410 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm37828-201ENSMUST00000192496 432 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm9379-201ENSMUST00000196790 646 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm42814-201ENSMUST00000199370 460 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm44092-201ENSMUST00000204470 258 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm5322-201ENSMUST00000206142 699 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm11213-202ENSMUST00000210529 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm18507-201ENSMUST00000218855 525 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 AC153662.1-201ENSMUST00000222220 270 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 AC173481.1-201ENSMUST00000223351 270 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Sprr2e-201ENSMUST00000068399 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Krtap31-1-201ENSMUST00000093935 973 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Vmn1r45-208ENSMUST00000228662 3309 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm34549-201ENSMUST00000207057 1611 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Olfr732-202ENSMUST00000213701 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Senp8-203ENSMUST00000177963 3792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm43883-201ENSMUST00000204002 3750 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 AC134860.3-201ENSMUST00000223564 1300 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm37848-201ENSMUST00000195288 3103 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Macc1-203ENSMUST00000221917 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 A630033H20Rik-206ENSMUST00000180182 2997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Olfr1033-205ENSMUST00000218397 3973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Olfr69-201ENSMUST00000106878 2829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 A630033H20Rik-201ENSMUST00000067249 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm23133-201ENSMUST00000104255 135 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm15151-201ENSMUST00000117106 177 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm15560-201ENSMUST00000117107 643 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Clec5a-204ENSMUST00000177178 665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm14419-204ENSMUST00000178182 192 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm2004-202ENSMUST00000178872 192 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm14295-203ENSMUST00000179435 192 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm27308-201ENSMUST00000184807 233 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm38270-201ENSMUST00000192721 407 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm38108-201ENSMUST00000193891 399 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm18984-201ENSMUST00000193998 1124 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm3143-202ENSMUST00000198364 675 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm42982-201ENSMUST00000198574 687 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 AC174780.1-201ENSMUST00000199415 1107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Fth-ps3-201ENSMUST00000210405 358 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm5175-202ENSMUST00000219699 529 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 AC154241.1-201ENSMUST00000223952 356 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Stfa1-201ENSMUST00000042097 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Olfr1253-201ENSMUST00000099765 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Olfr1446-203ENSMUST00000216805 2417 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Nlrp9a-204ENSMUST00000122040 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm25726-201ENSMUST00000104529 129 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm17732-201ENSMUST00000163259 821 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm28030-201ENSMUST00000184987 138 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Mrgprb12-ps-201ENSMUST00000186150 949 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm5731-201ENSMUST00000190969 481 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Smcp-202ENSMUST00000194965 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm43308-201ENSMUST00000197236 373 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm42457-201ENSMUST00000197572 367 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms