Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6947-201ENSMUST00000186254 78 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8600-201ENSMUST00000186320 905 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700010H22Rik-202ENSMUST00000187592 1003 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700095K22Rik-201ENSMUST00000206808 282 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm39033-201ENSMUST00000209158 1021 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18597-201ENSMUST00000209519 694 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr178-203ENSMUST00000215032 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd52-201ENSMUST00000000696 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr919-201ENSMUST00000071425 948 ntAPPRIS P2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr804-201ENSMUST00000077312 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr767-201ENSMUST00000082131 1086 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17655-202ENSMUST00000210275 1776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15356-201ENSMUST00000140669 2741 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1484-204ENSMUST00000216014 3842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1226-207ENSMUST00000220416 3387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10811-201ENSMUST00000221985 2448 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfpi-202ENSMUST00000090732 3576 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r76-201ENSMUST00000165771 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r101-201ENSMUST00000171914 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nlrp4b-202ENSMUST00000117413 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11823-201ENSMUST00000130582 2278 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr364-ps1-203ENSMUST00000217298 2894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mga-202ENSMUST00000079934 13304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kctd12b-201ENSMUST00000039424 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trbv13-1-201ENSMUST00000103268 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav6-7-dv9-201ENSMUST00000103638 379 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23697-201ENSMUST00000103897 110 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14811-201ENSMUST00000117070 117 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klrc2-203ENSMUST00000118401 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7421-201ENSMUST00000119298 639 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmgb1-ps6-201ENSMUST00000119503 616 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7365-201ENSMUST00000120877 639 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6762-201ENSMUST00000121769 289 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16471-201ENSMUST00000121940 618 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26254-201ENSMUST00000122491 118 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24936-201ENSMUST00000122598 247 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25106-201ENSMUST00000122672 134 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25806-201ENSMUST00000122782 122 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prlr-205ENSMUST00000128921 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2210408F21Rik-206ENSMUST00000138653 417 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15230-201ENSMUST00000153701 510 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24059-201ENSMUST00000157493 312 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24727-201ENSMUST00000158231 144 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gt(ROSA)26Sor-204ENSMUST00000167415 551 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17421-201ENSMUST00000167845 674 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20468-201ENSMUST00000172664 452 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26991-201ENSMUST00000180950 620 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27636-201ENSMUST00000184528 122 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29552-201ENSMUST00000190548 660 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44808-201ENSMUST00000208887 264 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm35857-201ENSMUST00000212739 178 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18228-201ENSMUST00000217297 1091 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sult6b1-201ENSMUST00000042683 839 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24950-201ENSMUST00000082768 191 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22043-201ENSMUST00000082993 158 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23971-201ENSMUST00000083317 191 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir26a-1-201ENSMUST00000083579 90 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23849-201ENSMUST00000083833 191 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26316-201ENSMUST00000083886 191 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr679-201ENSMUST00000098158 952 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r-ps36-201ENSMUST00000172589 2562 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Postn-203ENSMUST00000107985 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9343-201ENSMUST00000209016 2609 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr816-202ENSMUST00000213438 3306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cr2-212ENSMUST00000210219 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45540-201ENSMUST00000209271 3606 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r206-202ENSMUST00000227244 3970 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43486-201ENSMUST00000196431 4339 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp518a-201ENSMUST00000050092 6840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr711-202ENSMUST00000207200 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam46d-204ENSMUST00000167154 3004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.7 ms