Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Mrgprb12-ps-201ENSMUST00000186150 949 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm10988-201ENSMUST00000209150 1088 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm3978-201ENSMUST00000163406 2512 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc152-202ENSMUST00000226261 1327 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm3020-201ENSMUST00000112801 450 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm23837-201ENSMUST00000122656 286 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm25194-201ENSMUST00000177987 79 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm28146-201ENSMUST00000185517 701 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm28574-201ENSMUST00000185757 699 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm28397-201ENSMUST00000187970 699 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm29366-201ENSMUST00000190481 699 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm37111-201ENSMUST00000193250 634 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm43026-201ENSMUST00000202972 325 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm45236-201ENSMUST00000208632 229 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 AC087891.1-201ENSMUST00000217867 318 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 AC161269.1-201ENSMUST00000228426 318 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm43065-201ENSMUST00000198971 2092 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Olfr612-203ENSMUST00000215663 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm14915-201ENSMUST00000120747 204 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm24113-201ENSMUST00000157477 276 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm26988-201ENSMUST00000183296 945 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm28016-201ENSMUST00000184594 196 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Kcnmb2-206ENSMUST00000194796 338 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm19418-201ENSMUST00000197436 580 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 AC155929.1-201ENSMUST00000220217 1276 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hdac6Q9Z2V5 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms