Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Col5a3Q9JLI2 CT025680.1-201ENSMUST00000217375 375 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Col5a3Q9JLI2 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Col5a3Q9JLI2 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Col5a3Q9JLI2 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Col5a3Q9JLI2 Gm26129-201ENSMUST00000082719 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Col5a3Q9JLI2 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Col5a3Q9JLI2 Gm3665-201ENSMUST00000177214 2461 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Col5a3Q9JLI2 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Col5a3Q9JLI2 Gm13912-201ENSMUST00000156541 1860 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Col5a3Q9JLI2 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Col5a3Q9JLI2 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Col5a3Q9JLI2 Gm37868-201ENSMUST00000195578 2735 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Col5a3Q9JLI2 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Col5a3Q9JLI2 Olfr616-201ENSMUST00000106886 954 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Col5a3Q9JLI2 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Col5a3Q9JLI2 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Col5a3Q9JLI2 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Col5a3Q9JLI2 Gm14810-201ENSMUST00000121628 486 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Col5a3Q9JLI2 Gm14684-201ENSMUST00000145722 123 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Col5a3Q9JLI2 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Col5a3Q9JLI2 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Col5a3Q9JLI2 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Col5a3Q9JLI2 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Col5a3Q9JLI2 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Col5a3Q9JLI2 Gm44869-201ENSMUST00000208836 357 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Col5a3Q9JLI2 AC160931.2-201ENSMUST00000221445 351 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Col5a3Q9JLI2 AC166358.4-201ENSMUST00000223030 105 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Col5a3Q9JLI2 Mrgprx2-201ENSMUST00000098433 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm34549-201ENSMUST00000207057 1611 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Olfr1180-202ENSMUST00000216121 2079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm44542-201ENSMUST00000208677 4314 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm2033-201ENSMUST00000210753 2287 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm22956-201ENSMUST00000122520 80 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Olfr367-ps-202ENSMUST00000143957 942 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Scgb2b12-201ENSMUST00000183195 511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm27445-201ENSMUST00000184484 72 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm27538-201ENSMUST00000185065 294 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Olfr992-202ENSMUST00000213749 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 1700024I08Rik-203ENSMUST00000222372 754 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 AC091783.4-201ENSMUST00000224940 611 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm6195-201ENSMUST00000063059 357 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm7876-202ENSMUST00000171305 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm38069-201ENSMUST00000195360 2144 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Arhgap12-205ENSMUST00000182066 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Trdn-208ENSMUST00000219982 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm13865-201ENSMUST00000120957 865 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm23231-201ENSMUST00000157299 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm19726-201ENSMUST00000205008 240 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm39033-201ENSMUST00000209158 1021 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm22043-201ENSMUST00000082993 158 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Nlrp4b-202ENSMUST00000117413 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm3259-201ENSMUST00000101015 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Tbx22-201ENSMUST00000068451 2947 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Olfr1251-201ENSMUST00000214304 3133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Olfr644-203ENSMUST00000213991 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Olfr676-204ENSMUST00000219602 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Dnah7b-201ENSMUST00000069293 12314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Olfr1369-ps1-202ENSMUST00000213326 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 4932438A13Rik-217ENSMUST00000152564 15541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Olfr160-201ENSMUST00000104875 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm14926-201ENSMUST00000120650 508 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm11479-201ENSMUST00000134275 387 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm37900-201ENSMUST00000195510 3805 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm38088-201ENSMUST00000195829 241 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm45513-201ENSMUST00000210228 376 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 AC117797.2-201ENSMUST00000224419 531 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 CT009604.2-201ENSMUST00000225531 377 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 2810474O19Rik-208ENSMUST00000189837 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm5127-202ENSMUST00000101297 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
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