Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm21037-201ENSMUST00000209086 2608 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Vmn1r1-203ENSMUST00000227629 3654 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm11639-203ENSMUST00000212287 17665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gulp1-206ENSMUST00000162600 2798 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Olfr147-202ENSMUST00000214648 5356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Akap6-201ENSMUST00000095737 14847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm24429-201ENSMUST00000104076 132 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Nfia-204ENSMUST00000107057 8913 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm11146-201ENSMUST00000114231 96 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm11352-201ENSMUST00000119264 517 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm14951-201ENSMUST00000143622 570 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Grip1os2-201ENSMUST00000153898 722 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm24534-201ENSMUST00000157949 291 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Rian-214ENSMUST00000183026 596 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm37253-201ENSMUST00000195679 562 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm44927-201ENSMUST00000207573 716 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm45498-201ENSMUST00000210346 283 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Spata19-202ENSMUST00000214158 627 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 AC152946.2-201ENSMUST00000219071 337 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Ear14-201ENSMUST00000049559 468 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Mir338-201ENSMUST00000083666 98 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Olfr183-201ENSMUST00000073320 2040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Nxf3-201ENSMUST00000080929 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Plcz1-201ENSMUST00000032356 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm38278-201ENSMUST00000194715 1365 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Zfp931-202ENSMUST00000108924 962 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm14086-201ENSMUST00000117152 173 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Defa-ps12-201ENSMUST00000122353 193 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm26683-201ENSMUST00000181737 470 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm29556-201ENSMUST00000187591 696 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm28103-201ENSMUST00000188392 416 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm33354-201ENSMUST00000195448 906 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm6929-201ENSMUST00000210930 468 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 AC160863.2-201ENSMUST00000218392 858 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 4930556N09Rik-202ENSMUST00000219466 1015 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 AC154552.4-201ENSMUST00000222171 151 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
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