Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm29793-201ENSMUST00000202874 460 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1176-201ENSMUST00000057439 949 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1261-204ENSMUST00000216953 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm45483-201ENSMUST00000209845 1682 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm6584-201ENSMUST00000119671 447 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm3669-203ENSMUST00000133259 677 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm2165-204ENSMUST00000153493 677 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm11394-201ENSMUST00000181421 517 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 2010110G14Rik-201ENSMUST00000196438 527 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm18828-202ENSMUST00000181035 310 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Vmn2r-ps149-201ENSMUST00000188423 590 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm8319-201ENSMUST00000205708 641 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm44765-201ENSMUST00000206927 601 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.8 ms