Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Amd-ps5-201ENSMUST00000198406 989 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm45093-201ENSMUST00000206859 2463 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Cdh12-203ENSMUST00000227496 6004 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm8475-201ENSMUST00000118211 526 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm11830-201ENSMUST00000120175 561 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm8600-201ENSMUST00000186320 905 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Mir7118-201ENSMUST00000197760 61 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 AC102815.1-201ENSMUST00000226662 1061 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Fam111a-204ENSMUST00000151307 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Csmd3-201ENSMUST00000100670 13022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm10635-201ENSMUST00000217201 3721 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gmnc-201ENSMUST00000089832 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm14288-201ENSMUST00000109020 3438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Tbx22-201ENSMUST00000068451 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Chl1-201ENSMUST00000066905 7562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 4930421P07Rik-201ENSMUST00000147322 399 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm23671-201ENSMUST00000157472 103 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm24190-201ENSMUST00000157976 216 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Mir6398-201ENSMUST00000184541 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm30198-201ENSMUST00000222873 824 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Olfr134-201ENSMUST00000074883 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Ccr2-201ENSMUST00000055918 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 AC132237.1-201ENSMUST00000220950 4475 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm38286-201ENSMUST00000195128 3105 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm43875-201ENSMUST00000203319 2475 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Olfr1293-ps-203ENSMUST00000217845 3628 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm9208-201ENSMUST00000120468 948 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Mir6715-201ENSMUST00000184990 57 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 AC157572.3-201ENSMUST00000227288 303 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Olfr1326-ps1-201ENSMUST00000059880 3637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm12374-201ENSMUST00000147108 3299 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Olfr354-202ENSMUST00000217479 9539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Mmrn1-203ENSMUST00000204333 4472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Olfr873-205ENSMUST00000215540 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Olfr816-202ENSMUST00000213438 3306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm5943-201ENSMUST00000119458 459 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Snord92-201ENSMUST00000175548 85 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm27538-201ENSMUST00000185065 294 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm44399-201ENSMUST00000205043 226 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Olfr1224-ps1-206ENSMUST00000216976 2019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Ogt-201ENSMUST00000044475 5384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Olfr1050-ps1-201ENSMUST00000119802 947 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm27445-201ENSMUST00000184484 72 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Scgb2b21-201ENSMUST00000185407 520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Olfr337-ps1-202ENSMUST00000213375 526 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Olfr1176-201ENSMUST00000057439 949 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Cr2-212ENSMUST00000210219 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm7470-201ENSMUST00000194219 2095 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm9732-202ENSMUST00000163912 1757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm36927-201ENSMUST00000192504 1841 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm18609-201ENSMUST00000203370 3601 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm26988-201ENSMUST00000183296 945 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 AC166358.4-201ENSMUST00000223030 105 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Vmn1r71-205ENSMUST00000227940 4725 ntAPPRIS P2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Mgat4c-212ENSMUST00000179929 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Rps11-ps5-201ENSMUST00000117302 472 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm11479-201ENSMUST00000134275 387 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm25967-201ENSMUST00000157168 147 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc18Q640L5 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms