Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Dync2h1-206ENSMUST00000147193 13103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm38010-201ENSMUST00000192592 2784 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 AC155922.2-201ENSMUST00000220240 1458 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Vmn1r32-201ENSMUST00000079584 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Vmn1r90-207ENSMUST00000227692 7101 ntAPPRIS P2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Sult2a4-201ENSMUST00000108520 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Ctps2-203ENSMUST00000112300 741 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm5757-201ENSMUST00000117494 528 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Hmgb1-rs18-201ENSMUST00000117940 627 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm11262-201ENSMUST00000119326 833 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm13686-201ENSMUST00000122851 350 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm12603-202ENSMUST00000146678 618 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm24198-201ENSMUST00000157812 108 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm28153-201ENSMUST00000189853 629 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm42476-201ENSMUST00000198860 554 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm36520-201ENSMUST00000200449 400 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm43941-201ENSMUST00000203303 1073 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm45636-201ENSMUST00000210497 1064 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm18891-201ENSMUST00000216734 1087 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 AC153568.1-201ENSMUST00000218165 341 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm46401-202ENSMUST00000223425 803 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Prl3d3-202ENSMUST00000223958 675 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Vmn1r72-201ENSMUST00000053134 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm9964-201ENSMUST00000068448 728 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Olfr996-201ENSMUST00000077075 1068 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm23510-201ENSMUST00000083083 163 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm23677-201ENSMUST00000083156 104 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Sult2a2-201ENSMUST00000086148 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Olfr593-201ENSMUST00000098206 984 ntAPPRIS P2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Agtr2-201ENSMUST00000089188 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm37192-201ENSMUST00000194479 1348 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm37936-201ENSMUST00000194647 1322 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 4930510E17Rik-201ENSMUST00000034550 1639 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm29325-201ENSMUST00000190705 2528 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm19074-201ENSMUST00000218915 1429 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Elavl4-206ENSMUST00000106601 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Olfr168-202ENSMUST00000213480 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Plcb4-201ENSMUST00000035646 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm25169-201ENSMUST00000104190 129 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm15151-201ENSMUST00000117106 177 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm14365-201ENSMUST00000117535 587 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm17109-201ENSMUST00000163985 358 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm8161-201ENSMUST00000168739 481 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Nrg3os-201ENSMUST00000177141 927 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Zfp950-206ENSMUST00000178819 171 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm23816-201ENSMUST00000179617 132 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm27899-201ENSMUST00000184715 64 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm37987-201ENSMUST00000194999 825 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm42539-201ENSMUST00000197009 308 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm43559-201ENSMUST00000198755 466 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Zfp950-210ENSMUST00000205854 466 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 2200007N16Rik-201ENSMUST00000206367 238 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm2516-201ENSMUST00000210011 954 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Olfr153-201ENSMUST00000217113 1258 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 AC117797.2-201ENSMUST00000224419 531 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm7257-201ENSMUST00000041537 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm7117-201ENSMUST00000071515 387 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Olfr1148-201ENSMUST00000077580 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm23455-201ENSMUST00000083331 100 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Mir28a-201ENSMUST00000083560 86 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Mir99a-201ENSMUST00000083596 65 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 n-R5s182-201ENSMUST00000083889 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 AI314180-203ENSMUST00000107557 4946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Zfp759-201ENSMUST00000052716 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm4724-201ENSMUST00000109045 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm29968-201ENSMUST00000222815 1387 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm8995-201ENSMUST00000184842 7280 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 BB287469-201ENSMUST00000110149 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm4027-201ENSMUST00000164838 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm37639-201ENSMUST00000191623 2785 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Olfr1270-202ENSMUST00000213946 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Primpol-201ENSMUST00000040468 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 AC154313.1-201ENSMUST00000217755 3841 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Traj12-201ENSMUST00000103729 58 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm8666-201ENSMUST00000117517 292 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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