Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Cftr-201ENSMUST00000045706 6303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm3956-201ENSMUST00000164882 2560 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Vmn2r36-201ENSMUST00000170402 2561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm37764-201ENSMUST00000194664 2150 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm6902-202ENSMUST00000191169 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm6176-202ENSMUST00000207633 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 4932414N04Rik-204ENSMUST00000128259 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Vmn1r172-201ENSMUST00000038694 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Olfr1318-201ENSMUST00000058176 1690 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Olfr2-203ENSMUST00000208147 6178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm23014-201ENSMUST00000104144 130 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Sult2a5-201ENSMUST00000108525 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm15382-201ENSMUST00000118011 537 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Rpl23a-ps14-201ENSMUST00000118777 424 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm15333-201ENSMUST00000118825 364 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm14577-201ENSMUST00000121134 256 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm13471-201ENSMUST00000122057 433 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm12603-202ENSMUST00000146678 618 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm15338-201ENSMUST00000151884 552 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm22726-201ENSMUST00000158089 179 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm23773-201ENSMUST00000158985 296 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm16236-201ENSMUST00000159588 379 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm17030-201ENSMUST00000167016 393 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm18181-201ENSMUST00000190670 736 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm33973-201ENSMUST00000195148 534 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm45052-201ENSMUST00000206457 405 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm45031-201ENSMUST00000206800 288 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Olfr1498-ps1-201ENSMUST00000208721 991 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm18258-201ENSMUST00000210413 542 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm4788-201ENSMUST00000027612 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm10115-201ENSMUST00000076071 1228 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Olfr507-201ENSMUST00000080014 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm38065-201ENSMUST00000193147 3492 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Sbno1-201ENSMUST00000065263 10071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Olfr1501-202ENSMUST00000208493 4230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Olfr112-201ENSMUST00000085548 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Synpr-207ENSMUST00000223583 3362 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm42717-201ENSMUST00000197309 3463 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm37527-201ENSMUST00000192406 3547 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Neb-202ENSMUST00000036934 22489 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Olfr824-202ENSMUST00000214192 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Pde1a-205ENSMUST00000102654 4122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Olfr270-203ENSMUST00000215010 2502 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Vmn2r35-201ENSMUST00000169683 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm42583-201ENSMUST00000202678 6700 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 n-R5s219-201ENSMUST00000104328 132 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Clec1b-203ENSMUST00000112081 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Xlr5a-202ENSMUST00000114520 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Itpa-ps3-201ENSMUST00000119034 395 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Rps18-ps2-201ENSMUST00000119493 398 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm13220-201ENSMUST00000121535 508 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm24251-201ENSMUST00000157324 114 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps84-201ENSMUST00000173377 897 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 2010005H15Rik-203ENSMUST00000187742 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm28788-201ENSMUST00000189717 375 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm29558-201ENSMUST00000190134 375 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 2610044O15Rik8-206ENSMUST00000191043 504 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm37000-201ENSMUST00000193058 428 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm37167-201ENSMUST00000194946 396 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm43848-201ENSMUST00000198060 1247 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm44077-201ENSMUST00000203453 435 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm18016-201ENSMUST00000216119 801 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm5175-202ENSMUST00000219699 529 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm19134-201ENSMUST00000221203 487 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms