Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm39147-201ENSMUST00000211376 465 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PtprmP28828 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Vmn1r58-201ENSMUST00000108569 10140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PtprmP28828 4930533N22Rik-201ENSMUST00000206433 3509 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm8260-201ENSMUST00000119230 353 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm15361-201ENSMUST00000119320 444 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm11448-201ENSMUST00000120427 450 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm15142-201ENSMUST00000121013 856 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm17732-201ENSMUST00000163259 821 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PtprmP28828 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm45252-201ENSMUST00000211579 397 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PtprmP28828 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Prl2b1-201ENSMUST00000091678 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Mga-203ENSMUST00000110773 13577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Dnah7b-201ENSMUST00000069293 12314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm26733-201ENSMUST00000180846 2046 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm18913-201ENSMUST00000204311 1789 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PtprmP28828 B830012L14Rik-201ENSMUST00000182785 4505 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm14816-201ENSMUST00000117174 294 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm26477-201ENSMUST00000122617 323 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm14684-201ENSMUST00000145722 123 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PtprmP28828 1700123O12Rik-203ENSMUST00000145856 425 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Olfr1444-201ENSMUST00000059675 1129 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Calcrl-202ENSMUST00000099944 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Olfr1454-203ENSMUST00000214695 4049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Cmah-206ENSMUST00000167746 9727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PtprmP28828 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm44078-201ENSMUST00000204652 2646 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PtprmP28828 4930415L06Rik-201ENSMUST00000088146 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm14295-202ENSMUST00000132883 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm13607-201ENSMUST00000117875 539 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Ms4a4a-201ENSMUST00000188995 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm4859-201ENSMUST00000199625 787 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Olfr1136-201ENSMUST00000077471 1067 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Mir28a-201ENSMUST00000083560 86 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Vmn1r45-205ENSMUST00000227571 2757 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm11387-201ENSMUST00000120266 772 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Ear-ps10-201ENSMUST00000161871 460 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm28263-201ENSMUST00000185884 400 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Olfr213-202ENSMUST00000220008 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm13100-201ENSMUST00000117157 1439 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Olfr912-201ENSMUST00000217160 5726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtprmP28828 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtprmP28828 AC158631.2-201ENSMUST00000219999 478 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Fat2-202ENSMUST00000108864 14423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PtprmP28828 AC132237.1-201ENSMUST00000220950 4475 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Hdx-201ENSMUST00000038472 9385 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm12667-201ENSMUST00000118299 1332 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm14518-201ENSMUST00000117351 542 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm13064-201ENSMUST00000119125 557 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm8600-201ENSMUST00000186320 905 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm31831-202ENSMUST00000198581 278 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PtprmP28828 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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