Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm38091-201ENSMUST00000192418 3871 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Tecrl-201ENSMUST00000053543 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm7327-201ENSMUST00000120925 652 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm22345-201ENSMUST00000122644 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm21834-201ENSMUST00000178907 453 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm43645-201ENSMUST00000200129 341 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm8745-201ENSMUST00000207846 782 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm18442-201ENSMUST00000220925 639 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 AC154305.1-201ENSMUST00000224443 450 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm23645-201ENSMUST00000083228 108 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms