Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 CAAA01216754.6-201ENSMUST00000217183 398 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm18921-201ENSMUST00000221798 366 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 AC130547.1-201ENSMUST00000228079 1047 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Olfr885-201ENSMUST00000081985 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Kctd4-201ENSMUST00000050120 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gabra6-202ENSMUST00000109286 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Syne2-210ENSMUST00000143031 21704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm38265-201ENSMUST00000193479 3766 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Olfr729-203ENSMUST00000215327 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Olfr729-204ENSMUST00000215451 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Pkhd1l1-202ENSMUST00000166957 12747 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Pkhd1l1-201ENSMUST00000038336 12741 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Nae1-201ENSMUST00000034349 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm5938-201ENSMUST00000114030 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm16082-201ENSMUST00000115992 377 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm14687-201ENSMUST00000120206 363 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm13009-201ENSMUST00000121307 267 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm13667-201ENSMUST00000132332 617 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 Gm23592-201ENSMUST00000157859 117 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm16290-201ENSMUST00000161175 474 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm15143-201ENSMUST00000178180 714 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm29191-201ENSMUST00000185427 621 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 AV026068-206ENSMUST00000187461 513 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm28486-201ENSMUST00000188443 621 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm38080-201ENSMUST00000194035 268 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm43925-201ENSMUST00000203498 206 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm45189-201ENSMUST00000208567 363 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 CT030247.1-201ENSMUST00000216810 267 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 AC130673.2-201ENSMUST00000228091 797 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 2900092C05Rik-201ENSMUST00000032541 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 Olfr1450-201ENSMUST00000082006 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm37204-201ENSMUST00000192389 3961 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm37936-201ENSMUST00000194647 1322 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm20619-201ENSMUST00000175814 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 Vmn2r82-201ENSMUST00000170596 3045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 Olfr613-202ENSMUST00000214173 3840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm34549-201ENSMUST00000207057 1611 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Kcnrg-201ENSMUST00000051184 1766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Mier1-201ENSMUST00000030247 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 Gm29574-201ENSMUST00000186226 696 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm28828-201ENSMUST00000186601 696 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 Gm29339-201ENSMUST00000189613 696 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm28159-201ENSMUST00000190296 696 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm29366-201ENSMUST00000190481 699 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm29407-201ENSMUST00000191468 696 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm32295-201ENSMUST00000192558 696 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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