Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Acbd7-201ENSMUST00000115089 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm23226-201ENSMUST00000116927 103 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm8666-201ENSMUST00000117517 292 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm15110-201ENSMUST00000117545 881 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm14881-201ENSMUST00000120366 372 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm24503-201ENSMUST00000158454 135 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Ikzf2-209ENSMUST00000191262 1146 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm29522-201ENSMUST00000191530 621 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm37111-201ENSMUST00000193250 634 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm43559-201ENSMUST00000198755 466 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm44649-201ENSMUST00000205608 364 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Olfr1309-201ENSMUST00000207885 964 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 AC192616.1-201ENSMUST00000221922 132 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 4930455B14Rik-204ENSMUST00000224776 848 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Dynap-201ENSMUST00000025390 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm23510-201ENSMUST00000083083 163 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Mir202-201ENSMUST00000083568 72 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm22578-201ENSMUST00000083730 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 n-R5s151-201ENSMUST00000083959 119 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Mir465-201ENSMUST00000093563 74 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Olfr822-202ENSMUST00000216879 2663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Trim30b-205ENSMUST00000171830 2771 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Olfr213-202ENSMUST00000220008 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Olfr470-203ENSMUST00000220193 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Vmn2r31-201ENSMUST00000075108 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Olfr1178-202ENSMUST00000214040 6480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Oog1-201ENSMUST00000095509 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm7646-201ENSMUST00000198590 1346 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Vmn1r185-212ENSMUST00000228633 5385 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Syne1-205ENSMUST00000215295 27908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm26019-201ENSMUST00000104407 119 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm13664-201ENSMUST00000117304 345 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm14795-201ENSMUST00000118461 471 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm26354-201ENSMUST00000158221 129 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm22135-201ENSMUST00000158752 108 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm5974-201ENSMUST00000181607 986 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm26915-201ENSMUST00000183080 748 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm28471-201ENSMUST00000185994 615 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm29634-201ENSMUST00000188467 696 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm28699-201ENSMUST00000189193 696 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm29459-201ENSMUST00000191359 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm38333-201ENSMUST00000193608 604 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm43853-201ENSMUST00000197162 301 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm43897-201ENSMUST00000204019 309 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Zfp950-210ENSMUST00000205854 466 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 2500002B13Rik-202ENSMUST00000210752 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm19232-201ENSMUST00000211621 652 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 AC140210.1-201ENSMUST00000224961 534 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 AC168059.1-201ENSMUST00000225846 841 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 AC133189.2-201ENSMUST00000228527 392 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Olfr873-202ENSMUST00000075717 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Cysltr1-202ENSMUST00000113480 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Vmn1r80-204ENSMUST00000227471 6368 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Olfr782-202ENSMUST00000213970 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Vmn2r27-201ENSMUST00000100968 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Olfr588-ps1-201ENSMUST00000118682 4607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Zfp458-201ENSMUST00000045969 3488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Olfr1082-201ENSMUST00000215600 1620 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm38212-201ENSMUST00000194081 2756 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm6913-201ENSMUST00000100019 348 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm13567-201ENSMUST00000118026 247 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm2892-201ENSMUST00000145537 711 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm23499-201ENSMUST00000157736 268 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm24745-201ENSMUST00000157840 85 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm24961-201ENSMUST00000157918 184 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm24898-201ENSMUST00000158133 106 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm16303-201ENSMUST00000161498 390 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm5926-201ENSMUST00000177740 711 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms