Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm33378-201ENSMUST00000219831 2758 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Olfr1037-204ENSMUST00000216886 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm12845-202ENSMUST00000204276 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm40020-201ENSMUST00000215677 1635 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm12564-201ENSMUST00000119860 321 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm22492-201ENSMUST00000157192 297 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Obox4-ps26-201ENSMUST00000176368 724 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm42566-201ENSMUST00000197120 643 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm28236-203ENSMUST00000188311 1499 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm29070-202ENSMUST00000188541 1499 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm28545-201ENSMUST00000188667 1499 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm29616-201ENSMUST00000188777 1499 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm29162-202ENSMUST00000188893 1499 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm29338-201ENSMUST00000189318 1499 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm28454-203ENSMUST00000190183 1495 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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Rabgef1Q9JM13 Gm38370-201ENSMUST00000192545 1499 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm13228-201ENSMUST00000118937 634 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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