Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 AC174082.1-201ENSMUST00000221106 307 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 AC130536.1-201ENSMUST00000224425 271 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Olfr807-201ENSMUST00000059038 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm26176-201ENSMUST00000083795 105 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Olfr561-201ENSMUST00000098217 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Adam24-201ENSMUST00000051614 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Vmn2r83-201ENSMUST00000167976 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm12016-201ENSMUST00000119079 681 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm11719-201ENSMUST00000119399 351 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm15533-201ENSMUST00000126205 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Mir6418-201ENSMUST00000185075 115 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm17929-201ENSMUST00000186851 627 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm37571-201ENSMUST00000195048 614 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Olfr476-201ENSMUST00000077249 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm6215-201ENSMUST00000119297 1386 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm7905-201ENSMUST00000119933 1386 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Glyat-202ENSMUST00000119960 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm44625-201ENSMUST00000207838 1561 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 P2ry14-205ENSMUST00000197220 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Ak9-201ENSMUST00000173494 6968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 AC122382.2-201ENSMUST00000225128 3602 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Olfr1174-ps-201ENSMUST00000213348 1738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm12694-201ENSMUST00000149367 748 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm17103-201ENSMUST00000168897 549 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Vmn1r-ps66-201ENSMUST00000173436 612 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm26983-201ENSMUST00000182051 388 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm29105-201ENSMUST00000187256 450 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm44373-201ENSMUST00000196112 169 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm8681-201ENSMUST00000219115 618 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 4930563J15Rik-203ENSMUST00000219796 574 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Prl3d3-202ENSMUST00000223958 675 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 AC170086.1-201ENSMUST00000225190 497 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 AC138718.1-201ENSMUST00000225947 1009 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Vmn1r71-204ENSMUST00000227702 5034 ntAPPRIS P2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Olfr1257-202ENSMUST00000111519 2756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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