Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 2900042G08Rik-201ENSMUST00000221776 650 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm25205-201ENSMUST00000082841 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Olfr1309-202ENSMUST00000214537 4274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm44625-201ENSMUST00000207838 1561 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Nlrp4b-202ENSMUST00000117413 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm12025-201ENSMUST00000117768 144 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 4930556I23Rik-201ENSMUST00000160659 560 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm16563-201ENSMUST00000162673 423 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm18000-201ENSMUST00000212153 800 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Cd52-201ENSMUST00000000696 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm37672-201ENSMUST00000192682 4014 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Nlrp9a-204ENSMUST00000122040 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Olfr298-203ENSMUST00000216968 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Hfm1-202ENSMUST00000117588 4870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Dock11-202ENSMUST00000115264 1725 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Olfr1058-202ENSMUST00000213998 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Igkv9-124-201ENSMUST00000103312 287 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm24936-201ENSMUST00000122598 247 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm24976-201ENSMUST00000158972 135 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 AC153948.1-201ENSMUST00000219080 3838 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 AC160972.1-201ENSMUST00000220971 644 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 AC117656.3-202ENSMUST00000225842 1055 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Vmn1r81-203ENSMUST00000227973 14002 ntAPPRIS P2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Zfp850-203ENSMUST00000180502 6163 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm4788-202ENSMUST00000111986 2935 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr215-201ENSMUST00000061723 4112 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm26476-201ENSMUST00000122618 313 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm8247-202ENSMUST00000178759 375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm18384-201ENSMUST00000195974 808 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Cyp2b26-ps-201ENSMUST00000206238 1090 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm44765-201ENSMUST00000206927 601 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Zfp990-201ENSMUST00000105741 3044 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr1270-206ENSMUST00000217139 4803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr112-205ENSMUST00000213274 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Mkln1-201ENSMUST00000026699 11395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm24119-201ENSMUST00000103979 246 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm26100-201ENSMUST00000157245 127 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm20688-201ENSMUST00000176779 512 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm5175-202ENSMUST00000219699 529 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr924-201ENSMUST00000072977 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 4932415D10Rik-202ENSMUST00000217661 15111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Ddx60-202ENSMUST00000093485 5989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr826-203ENSMUST00000216661 2858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm13762-201ENSMUST00000144908 2612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm3443-201ENSMUST00000112772 285 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm14161-201ENSMUST00000137020 339 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm14684-201ENSMUST00000145722 123 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm29105-201ENSMUST00000187256 450 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm37587-202ENSMUST00000194935 475 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm44972-201ENSMUST00000206419 406 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr1444-201ENSMUST00000059675 1129 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Vmn1r43-201ENSMUST00000089418 1069 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Mbnl1-219ENSMUST00000194201 4319 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm26733-201ENSMUST00000180846 2046 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr699-203ENSMUST00000216307 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm5926-201ENSMUST00000177740 711 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr1005-ps1-201ENSMUST00000216207 488 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 AC124729.1-201ENSMUST00000225327 976 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Sprr2h-201ENSMUST00000059845 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr357-201ENSMUST00000069578 1092 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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