Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc18Q640L5 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc18Q640L5 Gm7652-201ENSMUST00000200440 1151 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc18Q640L5 Gm43227-201ENSMUST00000202239 677 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc18Q640L5 Gm43899-201ENSMUST00000203675 246 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc18Q640L5 Gm18672-201ENSMUST00000208035 270 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc18Q640L5 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc18Q640L5 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc18Q640L5 AC166369.3-201ENSMUST00000227286 409 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc18Q640L5 Gm42534-201ENSMUST00000196063 1754 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc18Q640L5 Gm13762-201ENSMUST00000144908 2612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc18Q640L5 Gm14810-201ENSMUST00000121628 486 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 2210408F21Rik-206ENSMUST00000138653 417 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm22722-201ENSMUST00000157467 132 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm22833-201ENSMUST00000158292 132 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm3123-201ENSMUST00000163480 480 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm28785-201ENSMUST00000187478 379 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Csn1s2a-209ENSMUST00000200322 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Ube2nl-201ENSMUST00000085228 456 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm4211-201ENSMUST00000181103 2220 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Mga-204ENSMUST00000110774 13931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Neb-202ENSMUST00000036934 22489 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Olfr665-204ENSMUST00000216971 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Olfr215-201ENSMUST00000061723 4112 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm44164-201ENSMUST00000203605 2561 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Olfr677-202ENSMUST00000213204 3227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm7853-201ENSMUST00000100708 478 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm13865-201ENSMUST00000120957 865 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm38088-201ENSMUST00000195829 241 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm19726-201ENSMUST00000205008 240 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Sult2a7-202ENSMUST00000209744 792 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Sprr2h-201ENSMUST00000059845 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Hfm1-202ENSMUST00000117588 4870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Vmn1r56-201ENSMUST00000169556 1832 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Pak3-201ENSMUST00000033640 8348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm37645-201ENSMUST00000194285 3556 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm36529-201ENSMUST00000222495 1529 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm27893-201ENSMUST00000184408 194 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm18505-201ENSMUST00000187360 790 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 AC125223.1-203ENSMUST00000225304 498 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm22979-201ENSMUST00000082609 159 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Pkhd1l1-203ENSMUST00000209244 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm37363-201ENSMUST00000192336 2233 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Vmn1r200-202ENSMUST00000226157 5505 ntAPPRIS P2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm37848-201ENSMUST00000195288 3103 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 AC124346.2-201ENSMUST00000217986 5083 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Mannr-201ENSMUST00000193549 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm43668-201ENSMUST00000197014 5342 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Olfr160-201ENSMUST00000104875 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm13761-201ENSMUST00000117238 807 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm17421-201ENSMUST00000167845 674 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm44649-201ENSMUST00000205608 364 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm8423-201ENSMUST00000211387 607 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 AC167669.3-201ENSMUST00000224720 393 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Olfr1046-201ENSMUST00000099902 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm14788-201ENSMUST00000119457 375 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 4933440J02Rik-201ENSMUST00000181547 1144 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm8282-201ENSMUST00000187559 483 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm36382-201ENSMUST00000198892 541 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Olfr676-204ENSMUST00000219602 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Olfr1317-204ENSMUST00000216988 2488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Nlrp4b-202ENSMUST00000117413 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 AC132336.1-201ENSMUST00000222844 1740 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc18Q640L5 Gm13692-201ENSMUST00000120774 371 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms