Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 4930562D21Rik-201ENSMUST00000123894 1750 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Olfr118-203ENSMUST00000216551 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Kcnrg-201ENSMUST00000051184 1766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps5-201ENSMUST00000175971 2730 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Olfr247-202ENSMUST00000215871 1983 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm13630-201ENSMUST00000127849 3650 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Neto2-201ENSMUST00000109686 5610 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Mga-204ENSMUST00000110774 13931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 AC113059.2-201ENSMUST00000213462 3016 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm24788-201ENSMUST00000104283 156 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Mir105-201ENSMUST00000104655 80 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm4596-201ENSMUST00000117197 442 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm11389-201ENSMUST00000121407 430 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm8200-201ENSMUST00000122390 222 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm13618-201ENSMUST00000128859 384 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm10059-201ENSMUST00000131139 171 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm23902-201ENSMUST00000157571 134 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Zfp456-202ENSMUST00000172266 679 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm27254-201ENSMUST00000183926 517 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm28619-201ENSMUST00000185889 622 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm28994-201ENSMUST00000188556 621 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 1700027A15Rik-203ENSMUST00000188793 423 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm38363-202ENSMUST00000195029 622 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm18327-201ENSMUST00000202426 830 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm18410-201ENSMUST00000207199 577 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm40608-201ENSMUST00000213692 654 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 AC156504.1-201ENSMUST00000214608 157 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 AC153382.1-201ENSMUST00000217953 1007 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 CT030242.2-201ENSMUST00000221588 148 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 AC091783.4-201ENSMUST00000224940 611 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Olfr1489-201ENSMUST00000053113 1111 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Xrn1-202ENSMUST00000185633 10256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Olfr1026-202ENSMUST00000217615 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm42534-201ENSMUST00000196063 1754 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm45804-201ENSMUST00000212137 3435 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm42717-201ENSMUST00000197309 3463 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm13640-201ENSMUST00000118445 264 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm12340-201ENSMUST00000121617 462 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm23111-201ENSMUST00000122652 105 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 4930451E10Rik-201ENSMUST00000130840 409 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm25908-201ENSMUST00000157624 98 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm25520-201ENSMUST00000158389 118 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps84-201ENSMUST00000173377 897 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm20619-204ENSMUST00000181343 786 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm28986-201ENSMUST00000189682 678 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm37059-201ENSMUST00000191723 678 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm43848-201ENSMUST00000198060 1247 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm42857-201ENSMUST00000200823 339 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm43028-201ENSMUST00000202561 481 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm4501-201ENSMUST00000207330 551 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Olfr485-201ENSMUST00000208296 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps50-201ENSMUST00000216908 453 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm5548-201ENSMUST00000055878 397 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Olfr781-201ENSMUST00000075613 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Olfr1490-201ENSMUST00000080162 951 ntAPPRIS P2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm25592-201ENSMUST00000082635 131 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Olfr1253-201ENSMUST00000099765 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Olfr1090-201ENSMUST00000099875 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Olfr629-203ENSMUST00000216300 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Trim30b-205ENSMUST00000171830 2771 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Cul4b-203ENSMUST00000115118 3344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Ntrk3-201ENSMUST00000039431 19703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Nbeal1-203ENSMUST00000160834 15731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Olfr1500-202ENSMUST00000214475 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Olfr1226-206ENSMUST00000217601 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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