Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 AY358078-201ENSMUST00000053821 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Olfr1101-202ENSMUST00000214411 3235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm3443-201ENSMUST00000112772 285 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm27374-201ENSMUST00000183660 81 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Igkv2-113-201ENSMUST00000196138 362 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Sprr2h-201ENSMUST00000059845 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Vmn1r46-204ENSMUST00000228231 13338 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Olfr1314-202ENSMUST00000207976 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm42486-201ENSMUST00000200369 3486 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Cngb3-201ENSMUST00000102999 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Vmn1r79-203ENSMUST00000227530 5581 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Mir291a-201ENSMUST00000104815 82 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm11262-201ENSMUST00000119326 833 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Tarbp2-207ENSMUST00000142114 420 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm24014-201ENSMUST00000157728 157 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm28924-201ENSMUST00000190012 241 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm42457-201ENSMUST00000197572 367 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 AC127371.1-201ENSMUST00000228516 312 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 AC153948.1-201ENSMUST00000219080 3838 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm43300-201ENSMUST00000198540 2043 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 4930415L06Rik-201ENSMUST00000088146 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Vmn1r62-201ENSMUST00000173956 1757 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm15949-201ENSMUST00000129485 126 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm17103-201ENSMUST00000168897 549 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Scgb2b21-201ENSMUST00000185407 520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Cyp3a63-ps-201ENSMUST00000196626 1170 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Cyp2b26-ps-201ENSMUST00000206238 1090 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Mbd3l1-203ENSMUST00000215255 708 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm33958-201ENSMUST00000222879 450 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm4788-201ENSMUST00000027612 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Olfr613-202ENSMUST00000214173 3840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Olfr1224-ps1-206ENSMUST00000216976 2019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 AC123035.1-201ENSMUST00000213846 2671 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm18189-201ENSMUST00000218153 1951 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm13831-201ENSMUST00000118764 302 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm5123-201ENSMUST00000121905 837 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm5755-201ENSMUST00000152394 837 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm29484-201ENSMUST00000186067 324 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm29334-201ENSMUST00000190334 357 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm18585-201ENSMUST00000215197 556 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Olfr681-201ENSMUST00000098157 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Vmn1r72-202ENSMUST00000209638 6501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm37792-201ENSMUST00000195761 3413 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 C130023A14Rik-201ENSMUST00000193537 3087 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Trav12d-2-201ENSMUST00000103593 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Trav12n-2-201ENSMUST00000103619 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm15142-201ENSMUST00000121013 856 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm12578-201ENSMUST00000121244 417 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm29259-201ENSMUST00000186396 694 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm29105-201ENSMUST00000187256 450 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm17954-201ENSMUST00000195893 607 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm42621-201ENSMUST00000198114 275 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm18423-201ENSMUST00000205144 1074 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Olfr1274-ps-202ENSMUST00000216111 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Olfr153-201ENSMUST00000217113 1258 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 AC153564.2-201ENSMUST00000219464 273 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 AC165164.2-201ENSMUST00000220313 392 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Foxp2-203ENSMUST00000115470 2692 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Gm7452-202ENSMUST00000202891 3039 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Sptan1P16546 Olfr1535-202ENSMUST00000217519 3959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms