Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm13697-202ENSMUST00000179552 732 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm29318-201ENSMUST00000185308 975 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm4412-201ENSMUST00000186660 433 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm28594-201ENSMUST00000187022 661 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm28830-201ENSMUST00000188192 213 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm8498-201ENSMUST00000188227 974 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Olfr1225-201ENSMUST00000188861 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm28654-201ENSMUST00000189801 379 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm42476-201ENSMUST00000198860 554 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 4930425K10Rik-201ENSMUST00000201190 745 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm44816-201ENSMUST00000206666 477 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 AC138401.2-201ENSMUST00000220461 365 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm9512-201ENSMUST00000223112 497 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 AC164116.1-201ENSMUST00000225810 622 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 AC131747.1-201ENSMUST00000226159 793 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 AC160756.1-201ENSMUST00000227266 235 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm25140-201ENSMUST00000083254 140 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 n-R5s152-201ENSMUST00000093641 119 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Olfr154-201ENSMUST00000099918 1079 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Olfr1469-202ENSMUST00000216910 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 0610010F05Rik-201ENSMUST00000043356 4392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Rps6ka3-204ENSMUST00000112493 3671 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Macf1-203ENSMUST00000097897 23495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm7452-202ENSMUST00000202891 3039 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Mc2r-201ENSMUST00000052347 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Olfr1500-204ENSMUST00000215760 2305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm45848-201ENSMUST00000212932 1871 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Olfr784-202ENSMUST00000214064 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Olfr1322-202ENSMUST00000217355 3886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Pkhd1l1-202ENSMUST00000166957 12747 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Pkhd1l1-201ENSMUST00000038336 12741 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 A230081H15Rik-201ENSMUST00000218326 2929 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Pde1a-205ENSMUST00000102654 4122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Olfr1477-201ENSMUST00000214274 3913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Adgrg2-201ENSMUST00000112398 3418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm23322-201ENSMUST00000104464 167 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm10964-201ENSMUST00000106852 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm13386-201ENSMUST00000117677 124 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Rps18-ps2-201ENSMUST00000119493 398 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm11718-201ENSMUST00000119942 537 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm5391-201ENSMUST00000121155 613 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm13555-201ENSMUST00000121668 319 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm16254-201ENSMUST00000131528 730 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm24898-201ENSMUST00000158133 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm16303-201ENSMUST00000161498 390 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm3123-201ENSMUST00000163480 480 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm24811-201ENSMUST00000175313 100 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm26933-201ENSMUST00000182320 827 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 C530043A13Rik-201ENSMUST00000186453 550 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm5372-201ENSMUST00000187540 409 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm3145-201ENSMUST00000188584 220 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm28920-201ENSMUST00000189957 699 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm35070-201ENSMUST00000192589 621 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm36971-201ENSMUST00000195244 378 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm30686-202ENSMUST00000195371 621 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm37095-201ENSMUST00000195421 205 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm44009-201ENSMUST00000203539 521 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm38832-201ENSMUST00000205674 400 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Olfr494-201ENSMUST00000209743 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm2544-201ENSMUST00000222702 756 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 AC154576.1-201ENSMUST00000225864 563 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 CT009711.3-201ENSMUST00000225882 250 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Fabp9-201ENSMUST00000029038 583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms