Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm15195-201ENSMUST00000118775 263 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Zfp783-203ENSMUST00000130463 537 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm20834-201ENSMUST00000179558 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Olfr106-ps-202ENSMUST00000214704 1791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Olfr510-203ENSMUST00000216331 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Olfr992-202ENSMUST00000213749 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm13122-201ENSMUST00000118380 453 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm25150-201ENSMUST00000157121 60 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm25666-201ENSMUST00000157702 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm17109-201ENSMUST00000163985 358 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Zfp456-202ENSMUST00000172266 679 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r-ps32-201ENSMUST00000174389 956 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Tmem167-ps3-201ENSMUST00000186718 178 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm42458-201ENSMUST00000201914 369 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.8 ms