Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm42976-201ENSMUST00000200313 222 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm45209-201ENSMUST00000207122 353 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Znrd1as-204ENSMUST00000209623 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Creg1-201ENSMUST00000040298 425 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Olfr134-201ENSMUST00000074883 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Olfr1136-201ENSMUST00000077471 1067 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Rpl32-ps-201ENSMUST00000091052 506 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Depdc1a-201ENSMUST00000029825 2920 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm42446-201ENSMUST00000199783 3284 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 C87414-206ENSMUST00000162964 2852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Olfr1500-204ENSMUST00000215760 2305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Nlrp4c-201ENSMUST00000037728 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm42585-201ENSMUST00000198731 4020 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm11782-201ENSMUST00000131675 2804 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm23532-201ENSMUST00000104569 112 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Sult2a1-201ENSMUST00000108522 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm14810-201ENSMUST00000121628 486 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm12858-201ENSMUST00000121913 208 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm15075-201ENSMUST00000122187 477 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm24592-201ENSMUST00000122505 106 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm11351-201ENSMUST00000139335 583 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Obox2-202ENSMUST00000172478 818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm22120-201ENSMUST00000175590 70 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Obox4-ps29-201ENSMUST00000175956 1134 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm27864-201ENSMUST00000183704 190 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm8296-201ENSMUST00000185597 524 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm28615-201ENSMUST00000187527 482 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 1700027A15Rik-203ENSMUST00000188793 423 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 1700023F02Rik-203ENSMUST00000189619 473 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm28872-201ENSMUST00000191518 158 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm37343-201ENSMUST00000192542 111 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm43559-201ENSMUST00000198755 466 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm36382-201ENSMUST00000198892 541 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm6929-201ENSMUST00000210930 468 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm5358-201ENSMUST00000212814 353 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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Ccl20O89093 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 AC154838.1-201ENSMUST00000228944 911 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Olfr790-201ENSMUST00000056002 1070 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Olfr748-201ENSMUST00000073561 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Olfr347-201ENSMUST00000078761 943 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
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Ccl20O89093 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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Ccl20O89093 Olfr810-201ENSMUST00000091986 1006 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Zfp600-204ENSMUST00000168483 4244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
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Ccl20O89093 Prl7d1-203ENSMUST00000224026 3657 ntAPPRIS P2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
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Ccl20O89093 Gabra3-202ENSMUST00000114554 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
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Ccl20O89093 AC153887.2-201ENSMUST00000219160 3838 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Olfr290-202ENSMUST00000214501 5196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Olfr290-204ENSMUST00000216367 5182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Pik3c2g-209ENSMUST00000187618 2023 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
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Ccl20O89093 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm22269-201ENSMUST00000104002 130 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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Ccl20O89093 Gm12543-201ENSMUST00000120410 543 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Etaa1os-202ENSMUST00000148496 388 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 H2al2c-201ENSMUST00000163651 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 H2al2b-201ENSMUST00000168551 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm27903-201ENSMUST00000175482 126 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Mir713-201ENSMUST00000178651 108 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm10292-201ENSMUST00000183142 581 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Mir6960-201ENSMUST00000183449 61 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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Ccl20O89093 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm32772-201ENSMUST00000205898 594 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm45553-201ENSMUST00000209929 507 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm36247-201ENSMUST00000211834 285 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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