Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm22174-201ENSMUST00000175050 125 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm22692-201ENSMUST00000175055 125 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm27634-201ENSMUST00000175060 126 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm22460-201ENSMUST00000175269 124 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm25535-201ENSMUST00000175364 125 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm24365-201ENSMUST00000175384 125 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm44310-201ENSMUST00000175424 126 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm22639-201ENSMUST00000175591 125 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DffaO54786 Ang-ps2-201ENSMUST00000178173 433 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm24979-201ENSMUST00000178626 126 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm27580-201ENSMUST00000183666 149 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm27743-201ENSMUST00000185136 126 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DffaO54786 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm29704-201ENSMUST00000196011 253 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm43841-201ENSMUST00000199491 586 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm44294-201ENSMUST00000205090 728 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DffaO54786 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DffaO54786 Olfr1033-202ENSMUST00000213865 3664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DffaO54786 AC153938.2-201ENSMUST00000218388 580 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm7119-201ENSMUST00000221345 695 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DffaO54786 Tbx22-201ENSMUST00000068451 2947 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
DffaO54786 Olfr775-201ENSMUST00000097163 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm38260-201ENSMUST00000193573 3995 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DffaO54786 Olfr617-202ENSMUST00000215755 3000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm10811-201ENSMUST00000221985 2448 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DffaO54786 Serpina7-201ENSMUST00000033626 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
DffaO54786 Zbtb41-201ENSMUST00000039867 8361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gabra3-202ENSMUST00000114554 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DffaO54786 Pkhd1l1-202ENSMUST00000166957 12747 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DffaO54786 Pkhd1l1-201ENSMUST00000038336 12741 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm12667-201ENSMUST00000118299 1332 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm9157-201ENSMUST00000117673 225 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm13122-201ENSMUST00000118380 453 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm22320-201ENSMUST00000157149 312 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm25966-201ENSMUST00000157169 117 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DffaO54786 Ighv5-8-201ENSMUST00000166255 278 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm7656-201ENSMUST00000182468 1004 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DffaO54786 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DffaO54786 AC124549.2-201ENSMUST00000224243 222 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DffaO54786 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm22864-201ENSMUST00000083950 130 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DffaO54786 Vmn2r-ps43-201ENSMUST00000173798 2473 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DffaO54786 Olfr1255-202ENSMUST00000214508 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm42446-201ENSMUST00000199783 3284 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DffaO54786 B3galt2-201ENSMUST00000038252 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
DffaO54786 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm3259-201ENSMUST00000101015 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
DffaO54786 Trbv15-201ENSMUST00000103273 370 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm22676-201ENSMUST00000116972 129 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm12118-201ENSMUST00000119766 532 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm25058-201ENSMUST00000157365 128 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm23755-201ENSMUST00000157578 343 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm24537-201ENSMUST00000157950 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm25606-201ENSMUST00000158363 95 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DffaO54786 Vmn1r126-201ENSMUST00000168398 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm27773-201ENSMUST00000184087 78 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm19637-201ENSMUST00000185933 579 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm28655-201ENSMUST00000191538 692 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DffaO54786 5033403H07Rik-203ENSMUST00000198580 467 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm43227-201ENSMUST00000202239 677 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm45020-201ENSMUST00000205356 381 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DffaO54786 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm30624-201ENSMUST00000220039 628 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DffaO54786 AC136976.1-201ENSMUST00000221440 381 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm10665-201ENSMUST00000098720 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm10666-201ENSMUST00000098722 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DffaO54786 Vmn1r114-201ENSMUST00000098737 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm10670-201ENSMUST00000098744 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DffaO54786 Vmn1r93-201ENSMUST00000098747 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DffaO54786 Rtl4-201ENSMUST00000096301 1758 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DffaO54786 Olfr1500-204ENSMUST00000215760 2305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DffaO54786 Olfr1231-202ENSMUST00000216144 3961 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DffaO54786 Nlrp9a-202ENSMUST00000108387 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
DffaO54786 Olfr1369-ps1-204ENSMUST00000215207 3794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DffaO54786 Lrrd1-201ENSMUST00000044039 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
DffaO54786 Olfr1322-202ENSMUST00000217355 3886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm14119-201ENSMUST00000119511 235 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm3160-201ENSMUST00000128343 607 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm7855-201ENSMUST00000137737 687 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm13752-201ENSMUST00000138195 491 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
DffaO54786 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
DffaO54786 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
DffaO54786 Grip1os2-201ENSMUST00000153898 722 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm43601-201ENSMUST00000196294 945 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm2189-201ENSMUST00000201419 429 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DffaO54786 Gm18540-201ENSMUST00000204025 526 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DffaO54786 Olfr439-ps1-201ENSMUST00000204679 307 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms