Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rian-201ENSMUST00000180876 8089 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r89-204ENSMUST00000227239 1992 ntAPPRIS P2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csmd3-209ENSMUST00000162830 13012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43665-201ENSMUST00000198672 1659 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr713-202ENSMUST00000213623 6329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1274-ps-202ENSMUST00000216111 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5347-201ENSMUST00000210542 2327 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl36a-ps3-201ENSMUST00000120093 321 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15267-201ENSMUST00000120888 464 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23791-201ENSMUST00000122553 293 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25438-201ENSMUST00000158281 110 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22890-201ENSMUST00000158642 144 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir3070b-201ENSMUST00000175205 89 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28974-201ENSMUST00000187893 231 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17777-201ENSMUST00000189740 1276 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29475-201ENSMUST00000190767 312 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43925-201ENSMUST00000203498 206 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700065L07Rik-201ENSMUST00000204961 614 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45200-201ENSMUST00000207434 919 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr337-ps1-202ENSMUST00000213375 526 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC160972.1-201ENSMUST00000220971 644 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsx-201ENSMUST00000033691 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Etd-201ENSMUST00000074232 478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25581-201ENSMUST00000083410 164 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr681-201ENSMUST00000098157 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1221-201ENSMUST00000099795 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mecom-203ENSMUST00000108271 3851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erbin-205ENSMUST00000188997 5084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klra2-201ENSMUST00000032306 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1183-203ENSMUST00000219871 8353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3089-201ENSMUST00000200804 1395 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3302-201ENSMUST00000201462 1395 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr986-202ENSMUST00000214763 3274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr113-201ENSMUST00000216181 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37298-201ENSMUST00000193770 3868 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr133-204ENSMUST00000215549 2944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam111a-204ENSMUST00000151307 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC121997.2-203ENSMUST00000228613 4192 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr836-203ENSMUST00000215981 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr837-202ENSMUST00000215699 3758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36944-201ENSMUST00000192257 2759 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igkv3-7-201ENSMUST00000103399 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24118-201ENSMUST00000103972 126 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25407-201ENSMUST00000104102 134 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11913-201ENSMUST00000119094 336 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11708-201ENSMUST00000119530 832 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700019E08Rik-202ENSMUST00000153567 635 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24930-201ENSMUST00000158315 83 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26028-201ENSMUST00000158660 294 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24976-201ENSMUST00000158972 135 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r163-201ENSMUST00000164537 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r128-201ENSMUST00000169165 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r135-201ENSMUST00000170931 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r143-201ENSMUST00000171622 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r-ps71-201ENSMUST00000172648 924 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28390-201ENSMUST00000185212 700 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43155-201ENSMUST00000202661 494 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC122464.1-201ENSMUST00000202789 770 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44995-201ENSMUST00000207056 504 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18194-201ENSMUST00000210455 481 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ly6e-ps1-201ENSMUST00000222501 367 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC124729.1-201ENSMUST00000225327 976 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154467.1-201ENSMUST00000227527 449 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC166369.1-201ENSMUST00000228126 351 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr357-201ENSMUST00000069578 1092 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4987-201ENSMUST00000078326 408 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10356-201ENSMUST00000097152 1258 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42888-201ENSMUST00000202425 4361 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r89-208ENSMUST00000228587 2061 ntAPPRIS P2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37792-201ENSMUST00000195761 3413 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfpi-203ENSMUST00000111711 3968 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Calcrl-202ENSMUST00000099944 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.3 ms