Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm26465-201ENSMUST00000178517 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm25021-201ENSMUST00000179184 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm24424-201ENSMUST00000179714 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm24389-201ENSMUST00000179962 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm25672-201ENSMUST00000180111 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm29163-201ENSMUST00000188029 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm37193-201ENSMUST00000193087 513 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm6929-201ENSMUST00000210930 468 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm45735-201ENSMUST00000212779 319 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 4930540M03Rik-201ENSMUST00000216952 437 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm18338-201ENSMUST00000222381 560 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 AC139294.1-201ENSMUST00000226708 571 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 AC156790.5-201ENSMUST00000227075 231 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Olfr1499-201ENSMUST00000055672 1052 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Olfr1462-201ENSMUST00000076832 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm23815-201ENSMUST00000083231 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r43-201ENSMUST00000089418 1069 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r203-201ENSMUST00000091729 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Ang6-201ENSMUST00000096869 444 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r66-205ENSMUST00000228622 3304 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Olfr769-203ENSMUST00000216906 4325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r58-201ENSMUST00000108569 10140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm45809-201ENSMUST00000211661 3894 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Olfr516-203ENSMUST00000217279 1441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm43705-201ENSMUST00000195958 3717 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r43-203ENSMUST00000226741 12542 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm6760-201ENSMUST00000114682 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm5943-201ENSMUST00000119458 459 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm8757-201ENSMUST00000119660 372 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Klra11-ps-201ENSMUST00000122033 810 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm13470-201ENSMUST00000123911 421 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm25427-201ENSMUST00000157605 103 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm17061-201ENSMUST00000163167 499 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm26824-201ENSMUST00000180506 1164 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Rhoay-ps3-201ENSMUST00000187648 576 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm36934-201ENSMUST00000192007 306 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm30275-202ENSMUST00000198124 416 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Olfr154-201ENSMUST00000099918 1079 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Olfr933-202ENSMUST00000216238 4475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm44525-201ENSMUST00000183129 2634 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm15613-201ENSMUST00000118396 326 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 R3hcc1l-202ENSMUST00000160107 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Cst12-202ENSMUST00000168443 546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Rp31-ps19-201ENSMUST00000180929 353 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Mpc1-ps-201ENSMUST00000181662 330 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Mir7028-201ENSMUST00000185016 64 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm29408-201ENSMUST00000187536 216 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm5372-201ENSMUST00000187540 409 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm28920-201ENSMUST00000189957 699 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm37438-201ENSMUST00000192813 393 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Mir1892-201ENSMUST00000197752 80 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm2314-201ENSMUST00000200391 586 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Olfr1542-ps1-201ENSMUST00000204175 752 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 2500002B13Rik-202ENSMUST00000210752 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 AC100733.1-201ENSMUST00000228494 407 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r26-201ENSMUST00000049694 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm10282-201ENSMUST00000075602 1151 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Gmnc-201ENSMUST00000089832 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Nlrp4c-201ENSMUST00000037728 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Atg4aQ8C9S8 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms