Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22395-201ENSMUST00000177427 96 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28615-201ENSMUST00000187527 482 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17951-201ENSMUST00000198536 496 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43468-201ENSMUST00000199769 397 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm19649-201ENSMUST00000201126 822 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Mir670hg-207ENSMUST00000211619 819 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr584-202ENSMUST00000214215 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1271-202ENSMUST00000216383 6613 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Pde1a-204ENSMUST00000102653 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23014-201ENSMUST00000104144 130 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14878-201ENSMUST00000118167 293 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Cylc2-203ENSMUST00000166749 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9376-201ENSMUST00000171107 729 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 9330182O14Rik-201ENSMUST00000179120 423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 4930404A12Rik-201ENSMUST00000199356 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Prl3d3-202ENSMUST00000223958 675 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr16-201ENSMUST00000038432 1050 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Mecom-201ENSMUST00000061088 348 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1253-201ENSMUST00000099765 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r219-203ENSMUST00000227388 7948 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Btbd35f13-201ENSMUST00000177912 1701 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22493-201ENSMUST00000104494 132 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14619-201ENSMUST00000120480 168 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16250-201ENSMUST00000148974 256 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15974-201ENSMUST00000159103 531 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 AV026068-206ENSMUST00000187461 513 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43370-201ENSMUST00000196437 284 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42896-201ENSMUST00000201249 1113 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8942-201ENSMUST00000217892 400 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 AC141884.1-201ENSMUST00000226327 636 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Dynlrb2-201ENSMUST00000078170 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Rbbp6-203ENSMUST00000098062 6345 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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