Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm37846-201ENSMUST00000191840 3774 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm11781-201ENSMUST00000118328 472 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm12195-201ENSMUST00000144990 469 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm22789-201ENSMUST00000157884 130 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Mir6410-201ENSMUST00000184204 104 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm28390-201ENSMUST00000185212 700 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm28785-201ENSMUST00000187478 379 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 CT010455.1-201ENSMUST00000218579 413 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 AC132112.1-201ENSMUST00000226354 505 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm4017-201ENSMUST00000084813 338 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm44078-201ENSMUST00000204652 2646 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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Usp48Q3V0C5 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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Usp48Q3V0C5 Gm28967-201ENSMUST00000187351 281 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm28103-201ENSMUST00000188392 416 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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Usp48Q3V0C5 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
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Usp48Q3V0C5 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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Usp48Q3V0C5 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
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Usp48Q3V0C5 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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Usp48Q3V0C5 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Trav15-1-dv6-1-201ENSMUST00000103653 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm6797-201ENSMUST00000119440 512 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm15142-201ENSMUST00000121013 856 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 4930401O12Rik-201ENSMUST00000153175 841 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm23179-201ENSMUST00000158693 304 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm8649-201ENSMUST00000181799 233 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 1700023F02Rik-203ENSMUST00000189619 473 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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