Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 AC159472.1-201ENSMUST00000218178 463 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 AC134528.1-201ENSMUST00000219156 387 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm18704-201ENSMUST00000219736 446 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 AC154592.1-201ENSMUST00000225784 574 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 AC164116.1-201ENSMUST00000225810 622 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Olfr693-201ENSMUST00000057817 952 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Olfr251-201ENSMUST00000072731 951 ntAPPRIS P2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Mup21-201ENSMUST00000077719 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Olfr1450-201ENSMUST00000082006 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm23846-201ENSMUST00000083835 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 n-R5s152-201ENSMUST00000093641 119 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gpr34-202ENSMUST00000096492 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Mgat4c-212ENSMUST00000179929 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Stk31-204ENSMUST00000172459 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Vmn1r39-206ENSMUST00000228651 2144 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Olfr301-201ENSMUST00000174362 1937 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Epyc-201ENSMUST00000020094 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Cr2-212ENSMUST00000210219 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Mc2r-201ENSMUST00000052347 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Kcnb2-201ENSMUST00000170146 14845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Senp8-203ENSMUST00000177963 3792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Klhl15-204ENSMUST00000113915 6241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Olfr1500-204ENSMUST00000215760 2305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Vmn1r80-204ENSMUST00000227471 6368 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 AC153150.1-201ENSMUST00000226065 3782 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm6757-201ENSMUST00000189810 1706 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Rpl38-ps1-201ENSMUST00000117723 215 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Rps12-ps26-201ENSMUST00000117751 333 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm13815-201ENSMUST00000119963 412 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Sult2a-ps1-201ENSMUST00000120317 341 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm9001-201ENSMUST00000121642 399 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm15563-201ENSMUST00000124953 410 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm12195-201ENSMUST00000144990 469 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm22819-201ENSMUST00000157445 303 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm26085-201ENSMUST00000157900 116 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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Sh3bp1P55194 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm37636-201ENSMUST00000193583 359 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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Sh3bp1P55194 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm3333-202ENSMUST00000221763 1044 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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Sh3bp1P55194 Dync2h1-204ENSMUST00000140466 14264 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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Sh3bp1P55194 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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Sh3bp1P55194 Chl1-201ENSMUST00000066905 7562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm4788-202ENSMUST00000111986 2935 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm42447-201ENSMUST00000200102 2903 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Olfr661-202ENSMUST00000214876 3790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm23594-201ENSMUST00000104307 134 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Smpx-202ENSMUST00000112520 503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 2210408F21Rik-202ENSMUST00000124811 384 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm23234-201ENSMUST00000157304 134 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm24774-201ENSMUST00000157384 134 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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Sh3bp1P55194 Gm20468-201ENSMUST00000172664 452 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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Sh3bp1P55194 Obox4-ps29-201ENSMUST00000175956 1134 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Mir6943-201ENSMUST00000185186 66 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm5368-201ENSMUST00000189012 589 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm28550-201ENSMUST00000189125 618 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm28460-202ENSMUST00000190590 618 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm7639-201ENSMUST00000212608 484 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sh3bp1P55194 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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