Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Olfr1051-202ENSMUST00000216432 2807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Olfr1051-203ENSMUST00000217245 2821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Olfr1051-204ENSMUST00000217294 2840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VdrP48281 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
VdrP48281 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VdrP48281 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm43594-201ENSMUST00000201153 3442 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm43320-201ENSMUST00000196047 2916 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VdrP48281 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VdrP48281 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
VdrP48281 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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VdrP48281 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VdrP48281 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VdrP48281 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
VdrP48281 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VdrP48281 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm28769-201ENSMUST00000190176 615 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VdrP48281 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VdrP48281 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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VdrP48281 AC153361.2-201ENSMUST00000218188 481 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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VdrP48281 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
VdrP48281 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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VdrP48281 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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VdrP48281 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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VdrP48281 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm14385-201ENSMUST00000116315 876 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm11576-201ENSMUST00000117433 417 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm9043-201ENSMUST00000119677 314 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm13273-201ENSMUST00000119737 159 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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VdrP48281 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VdrP48281 Cst12-202ENSMUST00000168443 546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VdrP48281 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VdrP48281 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VdrP48281 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm18505-201ENSMUST00000187360 790 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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