Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Wfdc17-201ENSMUST00000092836 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Olfr1137-201ENSMUST00000099850 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Olfr1051-201ENSMUST00000099898 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Vmn1r34-205ENSMUST00000227332 3075 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Hfm1-202ENSMUST00000117588 4870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Olfr992-203ENSMUST00000214895 2222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Olfr787-202ENSMUST00000213329 4958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Olfr1019-202ENSMUST00000213515 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm10340-201ENSMUST00000170790 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Olfr1341-203ENSMUST00000215117 4700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Olfr91-203ENSMUST00000217372 3809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Fscb-201ENSMUST00000059833 3361 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Sult6b1-204ENSMUST00000169544 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm8744-201ENSMUST00000204475 3581 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm38235-201ENSMUST00000194600 4952 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm12112-201ENSMUST00000117772 231 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm12571-201ENSMUST00000118132 243 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm12016-201ENSMUST00000119079 681 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Hspe1-ps6-201ENSMUST00000120275 283 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm15212-201ENSMUST00000122403 466 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm13941-201ENSMUST00000127918 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Mir1946a-201ENSMUST00000158360 134 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm27165-201ENSMUST00000183951 232 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm27457-201ENSMUST00000184771 156 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm8599-201ENSMUST00000193033 457 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm19418-201ENSMUST00000197436 580 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm43735-201ENSMUST00000198245 809 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm42500-201ENSMUST00000199898 517 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm17956-201ENSMUST00000199931 838 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm44282-201ENSMUST00000203199 190 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 AC087891.1-201ENSMUST00000217867 318 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 AC158686.2-201ENSMUST00000218599 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 AC158641.1-201ENSMUST00000218933 229 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Ceacam11-201ENSMUST00000094799 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Olfr1195-201ENSMUST00000099818 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Olfr646-202ENSMUST00000214099 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Steap2-204ENSMUST00000115426 10408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Elf1-202ENSMUST00000110835 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm15304-201ENSMUST00000122150 2640 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Tmem71-201ENSMUST00000048372 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gprc6a-203ENSMUST00000219286 2574 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 Zfp426-213ENSMUST00000169558 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RxraP28700 9130208D14Rik-201ENSMUST00000146911 7293 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RxraP28700 Ddi1-201ENSMUST00000051706 7114 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RxraP28700 Mapk8-203ENSMUST00000111943 1310 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RxraP28700 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm37862-201ENSMUST00000193079 2533 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm7957-201ENSMUST00000207404 2602 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RxraP28700 4930562D21Rik-201ENSMUST00000123894 1750 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RxraP28700 Foxr2-202ENSMUST00000163801 3072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RxraP28700 Psmc6-201ENSMUST00000022380 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RxraP28700 Zfp808-201ENSMUST00000099449 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RxraP28700 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm14322-201ENSMUST00000108942 1074 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RxraP28700 Clec1b-203ENSMUST00000112081 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm14322-202ENSMUST00000119838 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm13557-201ENSMUST00000120771 382 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm14418-202ENSMUST00000128657 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm15591-201ENSMUST00000138539 627 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm16064-201ENSMUST00000154997 464 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm25555-201ENSMUST00000158078 111 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm16545-201ENSMUST00000161968 463 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm3851-201ENSMUST00000168653 318 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RxraP28700 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RxraP28700 Vmn2r-ps85-201ENSMUST00000174022 940 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm22243-201ENSMUST00000178754 120 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RxraP28700 Nutf2-ps2-201ENSMUST00000179225 384 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RxraP28700 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm28412-201ENSMUST00000187243 177 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RxraP28700 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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