Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm9958-201ENSMUST00000068250 1284 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Eif1-ps1-201ENSMUST00000086606 330 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gprc6a-201ENSMUST00000020062 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm42484-201ENSMUST00000196075 2104 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Olfr787-202ENSMUST00000213329 4958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 5330437M03Rik-201ENSMUST00000201318 4083 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Olfr247-202ENSMUST00000215871 1983 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm36960-201ENSMUST00000195491 2035 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm43668-201ENSMUST00000197014 5342 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 AC153969.1-201ENSMUST00000214047 2605 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm14825-201ENSMUST00000113538 701 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm5938-201ENSMUST00000114030 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm15946-201ENSMUST00000160654 423 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm21834-201ENSMUST00000178907 453 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm21232-201ENSMUST00000182187 1006 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 1700074A21Rik-201ENSMUST00000192404 346 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm42470-201ENSMUST00000198086 251 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 2400006E01Rik-203ENSMUST00000199633 643 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm44059-201ENSMUST00000204048 351 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm5358-201ENSMUST00000212814 353 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 AC167250.1-201ENSMUST00000213739 3813 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Olfr768-201ENSMUST00000063031 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Ccr1-201ENSMUST00000026911 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm45352-201ENSMUST00000210140 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm38069-201ENSMUST00000195360 2144 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Ccser2-201ENSMUST00000067700 7334 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Cep290-206ENSMUST00000219765 7985 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm13912-201ENSMUST00000156541 1860 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 AC124586.1-201ENSMUST00000221673 2795 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm12149-201ENSMUST00000117511 654 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm12691-201ENSMUST00000120186 456 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm24636-201ENSMUST00000158673 288 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm16026-202ENSMUST00000159695 772 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Olfr325-201ENSMUST00000169428 1065 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm10074-201ENSMUST00000174543 249 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 A630033H20Rik-206ENSMUST00000180182 2997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm28591-201ENSMUST00000185259 183 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm37001-201ENSMUST00000193377 190 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm18747-201ENSMUST00000198129 648 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm42526-201ENSMUST00000198956 393 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm18306-201ENSMUST00000207338 569 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm44808-201ENSMUST00000208887 264 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Olfr91-203ENSMUST00000217372 3809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 AC124524.2-201ENSMUST00000223940 588 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Olfr209-201ENSMUST00000055868 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Olfr1202-201ENSMUST00000072057 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Vmn1r211-201ENSMUST00000073728 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Vmn1r52-201ENSMUST00000079832 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Fbxw23-202ENSMUST00000198480 1388 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Olfr709-ps1-202ENSMUST00000215468 5078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Has2-201ENSMUST00000050544 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm15773-201ENSMUST00000118665 1448 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Rps6ka3-204ENSMUST00000112493 3671 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps82-201ENSMUST00000174222 1641 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 AI987944-204ENSMUST00000206801 1701 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 AC152162.1-201ENSMUST00000225910 2917 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gabra3-202ENSMUST00000114554 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm37747-201ENSMUST00000193717 4003 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Fzd3-202ENSMUST00000131309 12734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 6720489N17Rik-202ENSMUST00000201563 2640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Zfp981-201ENSMUST00000105735 3038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Psg25-201ENSMUST00000094795 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Nlrp4c-201ENSMUST00000037728 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm23609-201ENSMUST00000104542 127 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm13470-201ENSMUST00000123911 421 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm22310-201ENSMUST00000157509 116 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms