Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm7034-201ENSMUST00000218638 645 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Mir19a-201ENSMUST00000083482 82 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm22828-201ENSMUST00000083768 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 AC151831.1-201ENSMUST00000227609 4033 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Rpl10-ps4-201ENSMUST00000117120 286 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm17364-201ENSMUST00000163881 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm25412-201ENSMUST00000180258 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm29192-201ENSMUST00000190942 377 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Tprkb-208ENSMUST00000200680 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Olfr308-201ENSMUST00000044256 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Olfr699-201ENSMUST00000065024 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 D630030B08Rik-201ENSMUST00000202983 3479 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Ctps2-203ENSMUST00000112300 741 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm15377-201ENSMUST00000119594 246 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm21814-201ENSMUST00000144085 291 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm11680-201ENSMUST00000146550 439 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.1 ms