Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TtrP07309 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TtrP07309 AC134596.2-201ENSMUST00000222158 171 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TtrP07309 n-R5s54-201ENSMUST00000083837 112 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm14325-201ENSMUST00000108939 1576 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm14308-201ENSMUST00000108990 1628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TtrP07309 Olfr1226-204ENSMUST00000215987 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm15679-201ENSMUST00000161244 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm4724-201ENSMUST00000109045 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TtrP07309 Zfp600-204ENSMUST00000168483 4244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm12845-202ENSMUST00000204276 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Vmn2r91-201ENSMUST00000172359 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 B020011L13Rik-201ENSMUST00000188801 2879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm19335-201ENSMUST00000195836 2069 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Oog1-202ENSMUST00000222112 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Ighv15-2-201ENSMUST00000103497 351 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm23133-201ENSMUST00000104255 135 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm14788-201ENSMUST00000119457 375 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm11600-201ENSMUST00000119592 240 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm25965-201ENSMUST00000157170 93 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm25438-201ENSMUST00000158281 110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm16101-201ENSMUST00000160695 430 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Ear-ps12-201ENSMUST00000161720 451 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm17030-201ENSMUST00000167016 393 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm5926-201ENSMUST00000177740 711 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm10067-201ENSMUST00000179462 348 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm43370-201ENSMUST00000196437 284 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Igkv15-101-1-201ENSMUST00000196661 258 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm42457-201ENSMUST00000197572 367 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm43441-201ENSMUST00000201458 205 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm44475-201ENSMUST00000204041 424 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm39033-201ENSMUST00000209158 1021 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm8785-201ENSMUST00000220259 487 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 AC132112.1-201ENSMUST00000226354 505 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 AC144798.1-201ENSMUST00000228120 391 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
TtrP07309 Pik3c2a-201ENSMUST00000170430 8044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
TtrP07309 Olfr1402-202ENSMUST00000199297 4051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
TtrP07309 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
TtrP07309 Gm37674-201ENSMUST00000194177 1834 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Cyp3a13-201ENSMUST00000031741 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Trim30d-202ENSMUST00000071069 3282 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Nlrp9a-204ENSMUST00000122040 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Olfr194-203ENSMUST00000216519 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Gm26886-204ENSMUST00000181772 2085 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Vmn1r46-203ENSMUST00000226715 10861 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Vmn1r46-205ENSMUST00000228349 10861 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Zfp934-202ENSMUST00000101547 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Ighv1-34-201ENSMUST00000103512 388 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Gm25726-201ENSMUST00000104529 129 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Gm12090-201ENSMUST00000118692 758 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Gm14687-201ENSMUST00000120206 363 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Zfp968-203ENSMUST00000131676 1272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Gm15733-201ENSMUST00000132957 242 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Etaa1os-202ENSMUST00000148496 388 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Gm23554-201ENSMUST00000157818 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Gm26933-201ENSMUST00000182320 827 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Mir6410-201ENSMUST00000184204 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Gm27308-201ENSMUST00000184807 233 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Gm6501-201ENSMUST00000187178 916 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Olfr1225-201ENSMUST00000188861 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Gm8790-201ENSMUST00000194108 322 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Gm3010-201ENSMUST00000198805 448 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Gm36520-201ENSMUST00000200449 400 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Gm18016-201ENSMUST00000216119 801 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Slfn5os-202ENSMUST00000216469 550 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 AC154368.1-201ENSMUST00000223465 205 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Gm4779-201ENSMUST00000056225 672 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Olfr996-201ENSMUST00000077075 1068 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Gm10794-201ENSMUST00000099624 207 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Olfr1186-203ENSMUST00000216978 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TtrP07309 Gm44527-202ENSMUST00000204519 1314 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms