Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm18039-201ENSMUST00000217816 728 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 AC154727.1-201ENSMUST00000226537 499 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Olfr603-201ENSMUST00000071844 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Olfr204-201ENSMUST00000072517 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Olfr818-201ENSMUST00000074308 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Olfr782-201ENSMUST00000077024 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Rpl21-ps14-201ENSMUST00000080279 483 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Vmn1r51-207ENSMUST00000227766 4218 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm38375-201ENSMUST00000194610 2227 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Macf1-206ENSMUST00000106224 23402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Zfp616-201ENSMUST00000074813 5014 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Vmn2r38-201ENSMUST00000108554 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Lztfl1-201ENSMUST00000026274 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Trdn-208ENSMUST00000219982 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm6982-201ENSMUST00000118752 1560 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Ecm2-201ENSMUST00000051504 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
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Ccl20O89093 Gm45093-201ENSMUST00000206859 2463 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Zfp945-205ENSMUST00000160457 6497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
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Ccl20O89093 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
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Ccl20O89093 Trav7n-4-201ENSMUST00000103609 341 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
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Ccl20O89093 Gm23271-201ENSMUST00000104052 124 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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Ccl20O89093 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm11195-201ENSMUST00000135030 441 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 4930421P07Rik-201ENSMUST00000147322 399 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm22531-201ENSMUST00000158819 140 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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Ccl20O89093 Gm25960-201ENSMUST00000175110 125 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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Ccl20O89093 Mir5127-201ENSMUST00000175295 71 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm25999-201ENSMUST00000175398 133 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm25195-201ENSMUST00000177656 126 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm29610-201ENSMUST00000187749 453 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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Ccl20O89093 Gm36954-201ENSMUST00000195362 363 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm31942-202ENSMUST00000195375 437 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
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Ccl20O89093 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
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Ccl20O89093 Dst-201ENSMUST00000097785 23251 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
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Ccl20O89093 Gm42728-201ENSMUST00000202644 1552 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Acsm3-203ENSMUST00000106527 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Zfp273-203ENSMUST00000181391 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Vmn1r90-207ENSMUST00000227692 7101 ntAPPRIS P2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Olfr19-202ENSMUST00000206365 1967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Cngb3-201ENSMUST00000102999 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Trbv13-1-201ENSMUST00000103268 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Igkv1-133-201ENSMUST00000103304 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Bsph2-201ENSMUST00000108526 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm11393-201ENSMUST00000118019 288 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm13359-201ENSMUST00000119000 695 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm14768-201ENSMUST00000122126 678 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm14684-201ENSMUST00000145722 123 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm13748-201ENSMUST00000149820 378 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm9017-201ENSMUST00000159613 676 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm20399-201ENSMUST00000174652 132 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm14527-201ENSMUST00000179300 639 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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