Protein–RNA interactions for Protein: O88892

Serf1, Small EDRK-rich factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serf1O88892 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm11913-201ENSMUST00000119094 336 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm9078-201ENSMUST00000119126 617 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm11456-201ENSMUST00000121070 256 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Serf1O88892 Hba-ps4-201ENSMUST00000128900 447 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm8790-201ENSMUST00000194108 322 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Serf1O88892 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Serf1O88892 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Serf1O88892 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Serf1O88892 Olfr476-201ENSMUST00000077249 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Serf1O88892 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Serf1O88892 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Serf1O88892 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Serf1O88892 Trim30b-205ENSMUST00000171830 2771 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm10811-201ENSMUST00000221985 2448 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Serf1O88892 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Serf1O88892 Olfr203-202ENSMUST00000215893 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Serf1O88892 Vmn2r66-201ENSMUST00000124773 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Serf1O88892 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Serf1O88892 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Serf1O88892 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Serf1O88892 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Serf1O88892 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm15951-201ENSMUST00000118377 400 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm11704-201ENSMUST00000120031 214 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm14553-201ENSMUST00000126711 1118 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm44864-201ENSMUST00000207292 505 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Serf1O88892 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Serf1O88892 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Serf1O88892 AC154727.1-201ENSMUST00000226537 499 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Serf1O88892 AC166369.3-201ENSMUST00000227286 409 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm10256-201ENSMUST00000179404 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Serf1O88892 Cep55-202ENSMUST00000116506 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Serf1O88892 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Serf1O88892 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 Olfr1231-202ENSMUST00000216144 3961 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm42888-201ENSMUST00000202425 4361 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 Smpx-202ENSMUST00000112520 503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm11372-201ENSMUST00000117348 570 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm12729-201ENSMUST00000130088 624 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm23554-201ENSMUST00000157818 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm27414-201ENSMUST00000185033 381 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm28390-201ENSMUST00000185212 700 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm28935-201ENSMUST00000185737 568 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm19637-201ENSMUST00000185933 579 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm6064-201ENSMUST00000203999 454 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 AU023762-202ENSMUST00000209716 961 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm45941-201ENSMUST00000221907 675 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 Snord35b-201ENSMUST00000082833 87 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 Olfr338-202ENSMUST00000091006 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm29968-201ENSMUST00000222815 1387 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 Spc25-201ENSMUST00000005365 1352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Serf1O88892 Tcrg-C1-201ENSMUST00000103558 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Serf1O88892 Mir291a-201ENSMUST00000104815 82 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Serf1O88892 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm5938-201ENSMUST00000114030 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Serf1O88892 Gm14581-201ENSMUST00000121726 198 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms