Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43508-201ENSMUST00000197251 3783 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13762-201ENSMUST00000144908 2612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r30-205ENSMUST00000228635 1776 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc22a30-203ENSMUST00000120540 2598 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr998-202ENSMUST00000215083 1399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154634.4-201ENSMUST00000226077 2665 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC149294.7-201ENSMUST00000227475 1432 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12358-201ENSMUST00000121842 520 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22988-201ENSMUST00000122759 144 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 8030453O22Rik-201ENSMUST00000128919 370 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1177-ps-201ENSMUST00000137895 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11640-201ENSMUST00000155987 272 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23957-201ENSMUST00000157209 90 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clec9a-203ENSMUST00000164513 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcgf1-204ENSMUST00000176089 492 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir6418-201ENSMUST00000185075 115 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3454-201ENSMUST00000185571 412 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28148-201ENSMUST00000186924 697 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28500-201ENSMUST00000190286 151 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44343-201ENSMUST00000196702 90 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC160124.1-201ENSMUST00000215539 519 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC100590.2-201ENSMUST00000219028 215 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT009604.2-201ENSMUST00000225531 377 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr308-201ENSMUST00000044256 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1309-203ENSMUST00000214935 5448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2042-207ENSMUST00000181326 2440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iigp1-201ENSMUST00000032473 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1043-204ENSMUST00000216028 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r22-202ENSMUST00000227650 3674 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159476.1-201ENSMUST00000215914 1668 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3616-201ENSMUST00000174430 2514 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3683-201ENSMUST00000175701 2513 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr598-202ENSMUST00000214765 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 St8sia4-204ENSMUST00000189556 10027 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10287-202ENSMUST00000180599 4059 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zmym2-201ENSMUST00000022511 6974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B020011L13Rik-201ENSMUST00000188801 2879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm40020-201ENSMUST00000215677 1635 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22023-201ENSMUST00000104354 130 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps15a-ps7-201ENSMUST00000117430 392 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13155-201ENSMUST00000119277 646 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8244-201ENSMUST00000121254 264 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8178-201ENSMUST00000121570 646 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tarbp2-207ENSMUST00000142114 420 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3646-201ENSMUST00000171319 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r-ps85-201ENSMUST00000174022 940 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18529-201ENSMUST00000193025 1257 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igkv13-57-1-201ENSMUST00000198063 305 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42621-201ENSMUST00000198114 275 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44927-201ENSMUST00000207573 716 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1295-202ENSMUST00000207786 1043 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44887-201ENSMUST00000208980 178 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr593-202ENSMUST00000210686 951 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17820-201ENSMUST00000220213 1068 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AL513022.1-201ENSMUST00000220489 504 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC165366.1-201ENSMUST00000225905 505 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl21-ps14-201ENSMUST00000080279 483 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps17-201ENSMUST00000080813 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snora31-201ENSMUST00000083213 130 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9330159F19Rik-201ENSMUST00000092627 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 F8-201ENSMUST00000033539 9784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1318-201ENSMUST00000058176 1690 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r80-209ENSMUST00000228578 11005 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nlrp9a-204ENSMUST00000122040 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
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