Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Glyat-202ENSMUST00000119960 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm12683-201ENSMUST00000117528 415 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm15364-201ENSMUST00000119618 585 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm11418-201ENSMUST00000156193 626 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm23167-201ENSMUST00000157155 103 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm25666-201ENSMUST00000157702 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r181-201ENSMUST00000181796 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm9560-201ENSMUST00000205012 1201 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm35371-201ENSMUST00000216204 579 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 AC087891.1-201ENSMUST00000217867 318 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 AC132112.1-201ENSMUST00000226354 505 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 AC134420.1-201ENSMUST00000227027 289 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Olfr1226-203ENSMUST00000215562 2669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm18432-201ENSMUST00000195568 1451 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm37606-201ENSMUST00000191816 3116 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Olfr360-202ENSMUST00000216706 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm13239-201ENSMUST00000119920 637 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm24060-201ENSMUST00000157494 95 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms