Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm42828-201ENSMUST00000199669 469 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm9560-201ENSMUST00000205012 1201 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 AL669916.5-201ENSMUST00000214874 361 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm35371-201ENSMUST00000216204 579 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Ifngas1-201ENSMUST00000220034 1121 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 AC159621.1-201ENSMUST00000223249 163 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 AC155237.2-201ENSMUST00000228487 478 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm19113-201ENSMUST00000217552 1828 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm23424-201ENSMUST00000103889 110 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm29228-201ENSMUST00000185489 418 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm38405-203ENSMUST00000208548 400 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm45735-201ENSMUST00000212779 319 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 AC153506.2-201ENSMUST00000218051 257 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 AC125531.1-201ENSMUST00000219849 221 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm25401-201ENSMUST00000082975 106 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Zfp708-201ENSMUST00000109742 2416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm11677-201ENSMUST00000121349 977 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms