Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Olfr1355-201ENSMUST00000078414 3317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm24855-201ENSMUST00000104848 97 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm12423-201ENSMUST00000118334 135 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm11381-201ENSMUST00000138574 420 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm25334-201ENSMUST00000158036 110 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm6486-201ENSMUST00000166202 434 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm36984-201ENSMUST00000192770 235 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm2077-201ENSMUST00000195017 319 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm42812-201ENSMUST00000199844 337 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Kcnj1-203ENSMUST00000213393 1277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Tmed10-203ENSMUST00000222585 619 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 AC161269.1-201ENSMUST00000228426 318 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm28940-201ENSMUST00000187929 1682 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm11790-201ENSMUST00000119569 455 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm12095-201ENSMUST00000121962 816 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm23179-201ENSMUST00000158693 304 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm30043-201ENSMUST00000196689 733 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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