Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm23460-201ENSMUST00000083258 109 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Zfp950-207ENSMUST00000180544 2568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr889-202ENSMUST00000217286 5673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 AC155922.2-201ENSMUST00000220240 1458 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Trav10n-201ENSMUST00000103612 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Mir669g-201ENSMUST00000116809 123 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Vmn1r-ps66-201ENSMUST00000173436 612 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm28967-201ENSMUST00000187351 281 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm42758-201ENSMUST00000202146 283 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm10988-201ENSMUST00000209150 1088 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm6049-201ENSMUST00000222369 458 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm5168-201ENSMUST00000089165 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr992-202ENSMUST00000213749 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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ptchd1Q14B62 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm22716-201ENSMUST00000177596 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 4930544M13Rik-202ENSMUST00000181553 1403 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm28103-201ENSMUST00000188392 416 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 1700023F02Rik-203ENSMUST00000189619 473 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm17781-201ENSMUST00000195232 649 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 D630030B08Rik-201ENSMUST00000202983 3479 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm19131-201ENSMUST00000203408 789 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm34549-201ENSMUST00000207057 1611 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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