Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 AC159809.1-201ENSMUST00000216235 520 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm30313-201ENSMUST00000216806 597 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 AC139638.1-201ENSMUST00000218027 364 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 AC154371.1-201ENSMUST00000226600 412 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm12582-201ENSMUST00000030555 697 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm26064-201ENSMUST00000083381 109 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Olfr360-202ENSMUST00000216706 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm336-201ENSMUST00000186376 1480 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Cnot6l-202ENSMUST00000113005 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Vmn1r219-203ENSMUST00000227388 7948 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm14322-201ENSMUST00000108942 1074 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm14050-201ENSMUST00000117052 346 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm11409-201ENSMUST00000118621 403 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm14688-201ENSMUST00000119169 303 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm12884-201ENSMUST00000120371 325 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm12332-201ENSMUST00000121397 922 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 2210408F21Rik-206ENSMUST00000138653 417 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm24910-201ENSMUST00000157289 272 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm24251-201ENSMUST00000157324 114 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm17023-201ENSMUST00000165885 448 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 4930519F16Rik-206ENSMUST00000183292 800 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm5372-201ENSMUST00000187540 409 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm28526-201ENSMUST00000187731 419 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm29443-202ENSMUST00000190297 410 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Ikzf2-209ENSMUST00000191262 1146 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm36954-201ENSMUST00000195362 363 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 2610306O10Rik-201ENSMUST00000206512 612 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Capza3-201ENSMUST00000043797 1222 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Olfr1013-201ENSMUST00000065626 918 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Olfr168-201ENSMUST00000078554 939 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm23875-201ENSMUST00000083711 318 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Slco1a1-201ENSMUST00000042119 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Olfr1217-203ENSMUST00000214022 3947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 AC122382.2-201ENSMUST00000225128 3602 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm38212-201ENSMUST00000194081 2756 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Dync2h1-201ENSMUST00000048417 13972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Lrp1b-209ENSMUST00000185258 1874 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Psmc6-201ENSMUST00000022380 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm24371-201ENSMUST00000122662 267 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm25427-201ENSMUST00000157605 103 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm25913-201ENSMUST00000157617 135 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm23501-201ENSMUST00000157744 256 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm23115-201ENSMUST00000158480 108 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Cylc2-203ENSMUST00000166749 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 1700027A15Rik-205ENSMUST00000191122 332 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm43020-201ENSMUST00000197178 372 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Mecom-201ENSMUST00000061088 348 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd13P70217 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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